RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	ASF1A	Q9Y294	204 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	FBN2	P35556	2912 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC78	A2IDD5	438 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	OR51F1	A6NGY5	319 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	ENO4	A6NNW6	628 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	TPM1	P09493	284 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	TPH1	P17752	444 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	MAGEA1	P43355	309 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	CACNG1	Q06432	222 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	PRPSAP1	Q14558	356 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	POU6F1	Q14863	301 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	CYP2A13	Q16696	494 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	HOOK3	Q86VS8	718 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	ELMO1	Q92556	727 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	PTER	Q96BW5	349 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	RCCD1	A6NED2	376 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	AGPS	O00116	658 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	SOCS6	O14544	535 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	AP2A2	O94973	939 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	METTL18	O95568	372 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	GSTM1	P09488	218 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	MAG	P20916	626 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	ITGA3	P26006	1051 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	PTPN7	P35236	360 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	GLRB	P48167	497 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	COPS2	P61201	443 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	GSTM4	Q03013	218 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	COX15	Q7KZN9	410 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	CNGA4	Q8IV77	575 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	ALG3	Q92685	438 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	SPSB2	Q99619	263 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	MENT	Q9BUN1	341 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	EURL	Q9NYK6	297 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	ISM1	B1AKI9	464 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	OR1I1	O60431	355 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	AP2A1	O95782	977 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	IGHE	P01854	428 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	MMP11	P24347	488 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	MCM3	P25205	808 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	CTNNA2	P26232	953 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	TNFRSF8	P28908	595 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	PKLR	P30613	574 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	FOXN2	P32314	431 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	NSG1	P42857	185 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	GDF10	P55107	478 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	PACS1	Q6VY07	963 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNMB4	Q86W47	210 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	VRK3	Q8IV63	474 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	TC2N	Q8N9U0	490 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	TTC13	Q8NBP0	860 aa		11.47	□□□□□ -0.57

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