RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591989.5

NEDD4L-233, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 233 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-233	ENST00000591989	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	PFDN6	O15212	129 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	PHF2	O75151	1096 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	GPC4	O75487	556 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	CREG1	O75629	220 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	RPN2	P04844	631 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	PAM	P19021	973 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	CYP2A7	P20853	494 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	AOAH	P28039	575 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	GPS2	Q13227	327 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	KCNAB2	Q13303	367 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	TTC23L	Q6PF05	361 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM136A	Q96C01	138 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	IL17F	Q96PD4	163 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	OR2A14	Q96R47	310 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	P2RY12	Q9H244	342 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM60A	Q9NP50	221 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	CDYL	Q9Y232	598 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NEDD4L-233	ENST00000591989	ITPR2	Q14571	2701 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	C21orf140	B9A014	251 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989		E7EQ34	232 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	KPNA5	O15131	536 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	NIPSNAP2	O75323	286 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMEM63A	O94886	807 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	FURIN	P09958	794 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	CHRM3	P20309	590 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	ARNT	P27540	789 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	ITGA1	P56199	1179 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	PPP1R7	Q15435	360 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	CYP1B1	Q16678	543 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMEM135	Q86UB9	458 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	LRRC6	Q86X45	466 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	TCTN2	Q96GX1	697 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	CHST8	Q9H2A9	424 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	ACTL8	Q9H568	366 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	SNX12	Q9UMY4	172 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	PCM1	Q15154	2024 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989		A0A0J9YY10	115 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	MAGEB16	A2A368	324 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	CTAGE9	A4FU28	777 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989		E5RI56	91 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	MEN1	O00255	615 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF749	O43361	778 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLCO2B1	O94956	709 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	CD9	P21926	228 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	PTPN4	P29074	926 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	PKLR	P30613	574 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	MAGEA6	P43360	314 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	BDKRB1	P46663	353 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	RAB28	P51157	221 aa		11.94	□□□□□ -0.5

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