RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 SOX8P57073 446 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 AADACL2Q6P093 401 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 TLDC1Q6P9B6 456 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM20CQ8IXL6 584 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D21Q8IYX1 336 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 ZADH2Q8N4Q0 377 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 TM9SF4Q92544 642 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 ELMO1Q92556 727 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 IRAK4Q9NWZ3 460 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 OR6C2Q9NZP2 312 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPN7P35236 360 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 POU6F1Q14863 301 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP2A13Q16696 494 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5K2Q8NHB8 316 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 POLG2Q9UHN1 485 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC78A2IDD5 438 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 OR51F1A6NGY5 319 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 ENO4A6NNW6 628 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 AGPSO00116 658 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL41O60662 606 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 ITGAXP20702 1163 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 NSG1P42857 185 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC5A12Q1EHB4 618 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 STYXQ8WUJ0 223 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC45Q96CN5 670 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 NDC1Q9BTX1 674 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 PLCL2Q9UPR0 1127 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL20Q9Y2M5 609 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC5A10A0PJK1 596 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 ISM1B1AKI9 464 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 ALOX12BO75342 701 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 METTL18O95568 372 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 AP2A1O95782 977 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 FTH1P02794 183 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 GCGRP47871 477 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 ITIH4Q14624 930 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 TMTC1Q8IUR5 882 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 TC2NQ8N9U0 490 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 EURLQ9NYK6 297 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXL4Q9UKA2 621 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 ITGA3P26006 1051 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 PARP6Q2NL67 630 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 SYTL3Q4VX76 610 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 PACS1Q6VY07 963 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC6A20Q9NP91 592 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 QSOX1O00391 747 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 SEC16AO15027 2179 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGP20916 626 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 ALAS2P22557 587 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMA3P25788 255 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 MSNP26038 577 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXN2P32314 431 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 KIR2DS3Q14952 304 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 HIF1AQ16665 826 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC13Q8NBP0 860 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 ALG3Q92685 438 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC40Q9H9A6 602 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 RCCD1A6NED2 376 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 MROH6A6NGR9 719 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 TJP3O95049 919 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 MMP11P24347 488 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 PKLRP30613 574 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 RWDD2BP57060 319 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 TTLL10Q6ZVT0 673 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 TICAM1Q8IUC6 712 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM71DQ8N9W8 422 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP4R1Q8TF05 950 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 FKBP10Q96AY3 582 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 IMPACTQ9P2X3 320 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 ITPR2Q14571 2701 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1B0GX78 115 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC162PA2VCL2 907 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 E2F3O00716 465 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 SOCS6O14544 535 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 OR1I1O60431 355 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 SPA17Q15506 151 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 COX15Q7KZN9 410 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNMB4Q86W47 210 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC01555Q8NAE3 123 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF214Q8ND24 703 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 SPSB2Q99619 263 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 MENTQ9BUN1 341 aa24.63■■□□□ 1.53
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