RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583282.5

GGA3-216, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-216	ENST00000583282	PHF19	Q5T6S3	580 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	LGSN	Q5TDP6	509 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	ASB11	Q8WXH4	323 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	ISL2	Q96A47	359 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	PTER	Q96BW5	349 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	NXNL1	Q96CM4	212 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	MTBP	Q96DY7	904 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	PKP4	Q99569	1192 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	DERL2	Q9GZP9	239 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	PPCS	Q9HAB8	311 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	PDE10A	Q9Y233	779 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	MYO1C	O00159	1063 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	BTN3A3	O00478	584 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	CDH16	O75309	829 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	DKK1	O94907	266 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	CPNE6	O95741	557 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	TFEB	P19484	476 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	CFHR1	Q03591	330 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	ZNF844	Q08AG5	666 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	PRKAA1	Q13131	559 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	OR4D1	Q15615	310 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	KRT71	Q3SY84	523 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	KLHL35	Q6PF15	583 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	SBSN	Q6UWP8	590 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	TRIM73	Q86UV7	250 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	TDRP	Q86YL5	185 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	CYP4X1	Q8N118	509 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	MZB1	Q8WU39	189 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	ZIM3	Q96PE6	472 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	MENT	Q9BUN1	341 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	ALG9	Q9H6U8	611 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	ARL15	Q9NXU5	204 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	ACOT9	Q9Y305	439 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-216	ENST00000583282	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-216	ENST00000583282		A8MU76	341 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-216	ENST00000583282	ISM1	B1AKI9	464 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-216	ENST00000583282	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-216	ENST00000583282	GFY	I3L273	518 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-216	ENST00000583282	SLC16A5	O15375	505 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-216	ENST00000583282	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-216	ENST00000583282	CS	O75390	466 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-216	ENST00000583282	SUPT3H	O75486	399 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-216	ENST00000583282	RASSF9	O75901	435 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-216	ENST00000583282	SLC16A8	O95907	504 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-216	ENST00000583282	MT-CO3	P00414	261 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-216	ENST00000583282	MT-ND3	P03897	115 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-216	ENST00000583282	MPO	P05164	745 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-216	ENST00000583282	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-216	ENST00000583282	PSMB5	P28074	263 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-216	ENST00000583282	IMPA1	P29218	277 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-216	ENST00000583282	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-216	ENST00000583282	CSRP3	P50461	194 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-216	ENST00000583282	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-216	ENST00000583282	ATP6V0D1	P61421	351 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-216	ENST00000583282	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-216	ENST00000583282	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-216	ENST00000583282	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-216	ENST00000583282	ANKS6	Q68DC2	871 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-216	ENST00000583282	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-216	ENST00000583282	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-216	ENST00000583282	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-216	ENST00000583282	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-216	ENST00000583282	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-216	ENST00000583282	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-216	ENST00000583282	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		13.58	□□□□□ -0.24

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