RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571855.1

ABCC3-218, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 3, humanhuman

Gene ABCC3, Length 1,562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC3-218ENST00000571855 IL17FQ96PD4 163 aa16.09■□□□□ 0.17
ABCC3-218ENST00000571855 EPB41L4BQ9H329 900 aa16.09■□□□□ 0.17
ABCC3-218ENST00000571855 POPDC3Q9HBV1 291 aa16.09■□□□□ 0.17
ABCC3-218ENST00000571855 SYTL2Q9HCH5 934 aa16.09■□□□□ 0.17
ABCC3-218ENST00000571855 GPAMQ9HCL2 828 aa16.09■□□□□ 0.17
ABCC3-218ENST00000571855 PIPSLA2A3N6 862 aa16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 GSAPA4D1B5 854 aa16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 PMS2P1A4D2B8 440 aa16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 RASGRF2O14827 1237 aa16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 PLD2O14939 933 aa16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 RASSF9O75901 435 aa16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 MPOP05164 745 aa16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 C8GP07360 202 aa16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 ANKRD34CP0C6C1 535 aa16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 STMN1P16949 149 aa16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 LSSP48449 732 aa16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 SLC29A2Q14542 456 aa16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 RTP5Q14D33 572 aa16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 CACHD1Q5VU97 1274 aa16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 PRSS42Q7Z5A4 293 aa16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 FBXO39Q8N4B4 442 aa16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 LINC01555Q8NAE3 123 aa16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 AGBL5Q8NDL9 886 aa16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 OR9A1PQ8NGU1 263 aa16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 DLG3Q92796 817 aa16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 GATA6Q92908 595 aa16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 CD180Q99467 661 aa16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 MAP3K3Q99759 626 aa16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 TWSG1Q9GZX9 223 aa16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 SEMA5BQ9P283 1151 aa16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 POMT2Q9UKY4 750 aa16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 LOXL2Q9Y4K0 774 aa16.08■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 HMX2A2RU54 273 aa16.07■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 TLCD2A6NGC4 264 aa16.07■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 C2orf74A8MZ97 194 aa16.07■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa16.07■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 MYO1CO00159 1063 aa16.07■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 INHBAP08476 426 aa16.07■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 MSH2P43246 934 aa16.07■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 RAB10P61026 200 aa16.07■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 GABREP78334 506 aa16.07■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 RAB42Q8N4Z0 105 aa16.07■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 OR2L8Q8NGY9 312 aa16.07■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 DENND1AQ8TEH3 1009 aa16.07■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 ANKRD49Q8WVL7 239 aa16.07■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 PPM1MQ96MI6 270 aa16.07■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 PAFAH2Q99487 392 aa16.07■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 PKP4Q99569 1192 aa16.07■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa16.07■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 SLC12A9Q9BXP2 914 aa16.07■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 SPHK1Q9NYA1 384 aa16.07■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 ACTR10Q9NZ32 417 aa16.07■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa16.07■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa16.07■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 AKAP13Q12802 2813 aa16.06■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa16.06■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa16.06■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 SLC16A5O15375 505 aa16.06■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 HGFP14210 728 aa16.06■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 SEPHS1P49903 392 aa16.06■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 SP140Q13342 867 aa16.06■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 MROH9Q5TGP6 573 aa16.06■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 FOXR1Q6PIV2 292 aa16.06■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 HMGCLL1Q8TB92 370 aa16.06■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 MCOLN3Q8TDD5 553 aa16.06■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 KLHL6Q8WZ60 621 aa16.06■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 NXPE2Q96DL1 559 aa16.06■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 PARD6BQ9BYG5 372 aa16.06■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 PARVBQ9HBI1 364 aa16.06■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 SPATA7Q9P0W8 599 aa16.06■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 PDE10AQ9Y233 779 aa16.06■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 AK5Q9Y6K8 562 aa16.06■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 IKBKGQ9Y6K9 419 aa16.06■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 ASPMQ8IZT6 3477 aa16.06■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 SYF2O95926 243 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 ERGP11308 486 aa16.05■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 CCL4P13236 92 aa16.05■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 ITIH1P19827 911 aa16.05■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 CYP2A7P20853 494 aa16.05■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 BMPR2Q13873 1038 aa16.05■□□□□ 0.16
ABCC3-218ENST00000571855 KIR2DS3Q14952 304 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.3 ms