RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	CDKL2	Q92772	493 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	INPP5D	Q92835	1189 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	NKD1	Q969G9	470 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	CFAP36	Q96G28	342 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	ZPBP	Q9BS86	351 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	SPRY4	Q9C004	299 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	ZFAT	Q9P243	1243 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM23-231	ENST00000557549	OR6C74	A6NCV1	312 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	C2orf74	A8MZ97	194 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	STMND1	H3BQB6	276 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	RASSF9	O75901	435 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	AHSG	P02765	367 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	PRB1	P04280	392 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	MPP1	Q00013	466 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	SLC7A5	Q01650	507 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	GUCY2D	Q02846	1103 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	KYNU	Q16719	465 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	RELL1	Q8IUW5	271 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	VRK3	Q8IV63	474 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	SLC39A7	Q92504	469 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	NRTN	Q99748	197 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	HGH1	Q9BTY7	390 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	MED16	Q9Y2X0	877 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	ATM	Q13315	3056 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	FKBP9	O95302	570 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	C1orf105	O95561	183 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	MPC1L	P0DKB6	136 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	GABRB3	P28472	473 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	MAGEA4	P43358	317 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	RAB28	P51157	221 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	RHD	Q02161	417 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	FOXM1	Q08050	763 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	ABR	Q12979	859 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	PRKG2	Q13237	762 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	IL11RA	Q14626	422 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	KIR2DS3	Q14952	304 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	CD200R1	Q8TD46	325 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	TTC9	Q92623	222 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	MAP3K3	Q99759	626 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	POMT2	Q9UKY4	750 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	ICK	Q9UPZ9	632 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	ATRX	P46100	2492 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	PIPSL	A2A3N6	862 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	BTN3A3	O00478	584 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	BTN3A1	O00481	513 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	RASGRF2	O14827	1237 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	MAP3K7	O43318	606 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	RAD1	O60671	282 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	MSL3P1	P0C860	447 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM23-231	ENST00000557549	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5

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