RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556210.1

CUX1-215, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CUX1, Length 4,044 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-215ENST00000556210 RAB39AQ14964 217 aa14.53□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 ENPP6Q6UWR7 440 aa14.53□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 KLK6Q92876 244 aa14.53□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 EGLN2Q96KS0 407 aa14.53□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 ZNF597Q96LX8 424 aa14.53□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 ARNT2Q9HBZ2 717 aa14.53□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 IL26Q9NPH9 171 aa14.53□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 CTPS2Q9NRF8 586 aa14.53□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 FAIMQ9NVQ4 179 aa14.53□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 KCTD5Q9NXV2 234 aa14.53□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa14.53□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 H0Y858 1186 aa14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 FPGTO14772 594 aa14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 XPNPEP2O43895 674 aa14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 ARF5P84085 180 aa14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 UBE3AQ05086 875 aa14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 LMAN2Q12907 356 aa14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 SELPLGQ14242 412 aa14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 IHHQ14623 411 aa14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 CYP2U1Q7Z449 544 aa14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 OR7A2PQ8NGA2 310 aa14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 OR2AP1Q8NGE2 309 aa14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 LINC01599Q8WXQ3 324 aa14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 SUV39H2Q9H5I1 410 aa14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 B4GALT6Q9UBX8 382 aa14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 RAB23Q9ULC3 237 aa14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 ASF1AQ9Y294 204 aa14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 TESMINQ9Y4I5 508 aa14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 TMEM247A6NEH6 219 aa14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 TGFB1P01137 390 aa14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 MTHFD2P13995 350 aa14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 PAX3P23760 479 aa14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 MAPK1P28482 360 aa14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 AP1S1P61966 158 aa14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 MFSD4BQ5TF39 518 aa14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 SUSD1Q6UWL2 747 aa14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 CHST9Q7L1S5 443 aa14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 TMEM199Q8N511 208 aa14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 TOP1MTQ969P6 601 aa14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 AP2M1Q96CW1 435 aa14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 C3orf18Q9UK00 162 aa14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 DYRK1BQ9Y463 629 aa14.52□□□□□ -0.08
CUX1-215ENST00000556210 AQP12BA6NM10 295 aa14.52□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 HLA-EP13747 358 aa14.52□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 CTNNB1P35222 781 aa14.52□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 ATP6V1E1P36543 226 aa14.52□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 MAGEA8P43361 318 aa14.52□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 RING1Q06587 406 aa14.52□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 HKDC1Q2TB90 917 aa14.52□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 MPPE1Q53F39 396 aa14.52□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 TTC23Q5W5X9 447 aa14.52□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa14.52□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 PPP4R4Q6NUP7 873 aa14.52□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 GPR153Q6NV75 609 aa14.52□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 BORAQ6PGQ7 559 aa14.52□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 AQP12AQ8IXF9 295 aa14.52□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa14.52□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 DHRS7Q9Y394 339 aa14.52□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 MROH6A6NGR9 719 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 PDZK1P1A8MUH7 402 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 BPIP17213 487 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 NSG1P42857 185 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 GPR1P46091 355 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 PMS2P3Q13401 168 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 PAGE2BQ5JRK9 111 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 MANEALQ5VSG8 457 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 MGME1Q9BQP7 344 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 LTB4R2Q9NPC1 389 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 VAPAQ9P0L0 249 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 INSL5Q9Y5Q6 135 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 H3BN98 237 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 ACOT8O14734 319 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 TEX28O15482 410 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 CSF2RAP15509 400 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 ACADVLP49748 655 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 DSC1Q08554 894 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 MGAT3Q09327 533 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 TMEM220Q6QAJ8 160 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 TMEM151AQ8N4L1 468 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 CHST14Q8NCH0 376 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 KREMEN2Q8NCW0 462 aa14.51□□□□□ -0.09
CUX1-215ENST00000556210 OR2T11Q8NH01 316 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms