RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa18.78■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C2orf74A8MZ97 194 aa18.78■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 QSOX1O00391 747 aa18.78■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BTN3A1O00481 513 aa18.78■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCL22O00626 93 aa18.78■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRT14P02533 472 aa18.78■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GSTM1P09488 218 aa18.78■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AGXTP21549 392 aa18.78■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ACRV1P26436 265 aa18.78■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NPY2RP49146 381 aa18.78■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RRADP55042 308 aa18.78■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ITGA1P56199 1179 aa18.78■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRAMEP78395 509 aa18.78■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GSTM4Q03013 218 aa18.78■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM198BQ6UWH4 519 aa18.78■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SERPINA9Q86WD7 417 aa18.78■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZBTB2Q8N680 514 aa18.78■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PHC3Q8NDX5 983 aa18.78■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR52E1Q8NGJ3 308 aa18.78■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IL22Q9GZX6 179 aa18.78■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SEC16AO15027 2179 aa18.78■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPTBP11277 2137 aa18.77■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCDC78A2IDD5 438 aa18.77■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 E7EQ34 232 aa18.77■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TPSB2P20231 275 aa18.77■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PSMA3P25788 255 aa18.77■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PDHA2P29803 388 aa18.77■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GRIA1P42261 906 aa18.77■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GPS1Q13098 491 aa18.77■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NCF4Q15080 339 aa18.77■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TPSAB1Q15661 275 aa18.77■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PCID2Q5JVF3 399 aa18.77■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TSTD2Q5T7W7 516 aa18.77■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM69BQ5VUD6 431 aa18.77■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR6P1Q8NGX9 317 aa18.77■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SSC4DQ8WTU2 575 aa18.77■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DHRS4Q9BTZ2 278 aa18.77■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NUDT9Q9BW91 350 aa18.77■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLAMF7Q9NQ25 335 aa18.77■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANAPC5Q9UJX4 755 aa18.77■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PADI2Q9Y2J8 665 aa18.77■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TCAF1Q9Y4C2 921 aa18.77■□□□□ 0.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NOTCH2Q04721 2471 aa18.77■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ICE1Q9Y2F5 2266 aa18.76■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa18.76■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A6NL46 340 aa18.76■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C9J4A7 227 aa18.76■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCDC188H7C350 402 aa18.76■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF749O43361 778 aa18.76■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AP2A2O94973 939 aa18.76■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TUBB4AP04350 444 aa18.76■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PAFAH1B1P43034 410 aa18.76■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VPS41P49754 854 aa18.76■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ITIH4Q14624 930 aa18.76■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KCNJ11Q14654 390 aa18.76■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PTCHD3Q3KNS1 767 aa18.76■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARMC3Q5W041 872 aa18.76■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAB43Q86YS6 212 aa18.76■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LURAP1LQ8IV03 231 aa18.76■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GPR135Q8IZ08 494 aa18.76■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa18.76■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C17orf62Q9BQA9 187 aa18.76■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GPR83Q9NYM4 423 aa18.76■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ACTR10Q9NZ32 417 aa18.76■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UNC79Q9P2D8 2635 aa18.75■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCDC162PA2VCL2 907 aa18.75■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PVRP15151 417 aa18.75■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NSG1P42857 185 aa18.75■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRKG2Q13237 762 aa18.75■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPP1R7Q15435 360 aa18.75■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa18.75■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF534Q76KX8 674 aa18.75■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HOOK3Q86VS8 718 aa18.75■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CLDN19Q8N6F1 224 aa18.75■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 Q8NA96 180 aa18.75■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HDAC10Q969S8 669 aa18.75■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PNPLA2Q96AD5 504 aa18.75■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SGSM3Q96HU1 749 aa18.75■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IP6K3Q96PC2 410 aa18.75■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NRTNQ99748 197 aa18.75■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TSSK1BQ9BXA7 367 aa18.75■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MFRPQ9BY79 579 aa18.75■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KLHL25Q9H0H3 589 aa18.75■□□□□ 0.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 XKR8Q9H6D3 395 aa18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms