RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553486.5

ABCD4-218, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ABCD4, Length 1,842 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-218ENST00000553486 TMIEQ8NEW7 156 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-218ENST00000553486 MCOLN3Q8TDD5 553 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-218ENST00000553486 ASZ1Q8WWH4 475 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-218ENST00000553486 OR8D1Q8WZ84 308 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-218ENST00000553486 SLC29A3Q9BZD2 475 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-218ENST00000553486 SLC52A3Q9NQ40 469 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-218ENST00000553486 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-218ENST00000553486 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-218ENST00000553486 CACNA1AO00555 2505 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-218ENST00000553486 CCDC154A6NI56 674 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-218ENST00000553486 HEPACAM2A8MVW5 462 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-218ENST00000553486 PRRT4C9JH25 899 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-218ENST00000553486 WNT9AO14904 365 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-218ENST00000553486 LSM1O15116 133 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-218ENST00000553486 MTX2O75431 263 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-218ENST00000553486 EEDO75530 441 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-218ENST00000553486 AP1S2P56377 157 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-218ENST00000553486 ABRAXAS2Q15018 415 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-218ENST00000553486 PDGFRLQ15198 375 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-218ENST00000553486 TRIP10Q15642 601 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-218ENST00000553486 AP5B1Q2VPB7 878 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-218ENST00000553486 ZNF528Q3MIS6 628 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-218ENST00000553486 GLYATL1Q969I3 302 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-218ENST00000553486 AP2M1Q96CW1 435 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-218ENST00000553486 LRRC58Q96CX6 371 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-218ENST00000553486 ZFYVE19Q96K21 471 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-218ENST00000553486 LRGUKQ96M69 825 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-218ENST00000553486 NELL2Q99435 816 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-218ENST00000553486 IL1RL2Q9HB29 575 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-218ENST00000553486 ZFP14Q9HCL3 533 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-218ENST00000553486 ABCD2Q9UBJ2 740 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-218ENST00000553486 FBXO4Q9UKT5 387 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-218ENST00000553486 FADS2P1A8MWK0 482 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 GFYI3L273 518 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 LAMTOR5O43504 91 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 PEX1O43933 1283 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 ULK1O75385 1050 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 CLDN9O95484 217 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 ELP6Q0PNE2 266 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 PRKG2Q13237 762 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 IRGCQ6NXR0 463 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 ZNF852Q6ZMS4 543 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 DNASE1L2Q92874 299 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 CLDN23Q96B33 292 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 TRPV4Q9HBA0 871 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 KLQ9UEF7 1012 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 RNF11Q9Y3C5 154 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 SHISA7A6NL88 538 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 C9JVG2 144 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 SGTAO43765 313 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 NPPAP01160 153 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 KRT6AP02538 564 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 KRT6BP04259 564 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 C8BP07358 591 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 ITGB7P26010 798 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 ID4P47928 161 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 KRT6CP48668 564 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 CREB5Q02930 508 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 NFYCQ13952 458 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 GRM2Q14416 872 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 IL23RQ5VWK5 629 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 LPCAT4Q643R3 524 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 TRIM46Q7Z4K8 759 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 PDSS2Q86YH6 399 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 VRK3Q8IV63 474 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 CATSPER1Q8NEC5 780 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 TEX37Q96LM6 180 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 FAM83CQ9BQN1 747 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 SLC39A3Q9BRY0 314 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 PCDHAC1Q9H158 963 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 ACTR8Q9H981 624 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 LRRK1Q38SD2 2015 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 MANBAO00462 879 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 FFAR3O14843 346 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 GPR42O15529 346 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 ATG13O75143 517 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 SLCO2B1O94956 709 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 HSD17B1P14061 328 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 SLC2A4P14672 509 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 PEX2P28328 305 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 RPS9P46781 194 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 RHDQ02161 417 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 KLC1Q07866 573 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 IMPG1Q17R60 797 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 GAB4Q2WGN9 574 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 C9orf64Q5T6V5 341 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-218ENST00000553486 FBXL19Q6PCT2 694 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms