RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 C1orf21Q9H246 121 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 C3orf18Q9UK00 162 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 HSPB11Q9Y547 144 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 C5P01031 1676 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SLC38A8A6NNN8 435 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SLC30A4O14863 429 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SLC35G4P0C7Q5 338 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CASP1P29466 404 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 NOS3P29474 1203 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MAGEA3P43357 314 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MAGEA11P43364 429 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SUOXP51687 545 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GALCP54803 685 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 UCNP55089 124 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ERVFC1P60507 584 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 AP1S1P61966 158 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CHRNEQ04844 493 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RGS1Q08116 209 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 DUSP4Q13115 394 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 BTN1A1Q13410 526 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RALGPS1Q5JS13 557 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGAP40Q5TG30 622 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 STEAP3Q658P3 488 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PPIL6Q8IXY8 311 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 DEFB106AQ8N104 65 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 POMGNT2Q8NAT1 580 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ETNPPLQ8TBG4 499 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 FAR1Q8WVX9 515 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GAB3Q8WWW8 586 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 HSD17B14Q9BPX1 270 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 DPEP3Q9H4B8 488 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 NDOR1Q9UHB4 597 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1B0GVM2 712 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TCAF2A6NFQ2 919 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 HMX3A6NHT5 357 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SOBPA7XYQ1 873 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 M0R036 132 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 M0R296 226 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ALOX15BO15296 676 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RFPL2O75678 378 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 IDSP22304 550 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PIK3R1P27986 724 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RAB13P51153 203 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MAB21L1Q13394 359 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TFDP3Q5H9I0 405 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 UBE2UQ5VVX9 321 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 OR52E8Q6IFG1 317 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SLC30A6Q6NXT4 461 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PLET1Q6UQ28 207 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SLC24A4Q8NFF2 622 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 OR6S1Q8NH40 331 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CYP2W1Q8TAV3 490 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 FAM174AQ8TBP5 190 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TAS1R2Q8TE23 839 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 AP3S1Q92572 193 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 NXNL1Q96CM4 212 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF251Q9BRH9 671 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ADA2Q9NZK5 511 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SCML1Q9UN30 329 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PTPRJQ12913 1337 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 FAM205CA6NFA0 338 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CLCA1A8K7I4 914 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 A8MUI8 341 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 KRBOX1C9JBD0 128 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 J3KRW8 73 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TOR1AO14656 332 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TEX33O43247 280 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 VEGFDO43915 354 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 VPS4BO75351 444 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PROSCO94903 275 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 POP4O95707 220 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 UGT2B4P06133 528 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 EPHX1P07099 455 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PET100P0DJ07 73 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 FCGR1AP12314 374 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RPL3P39023 403 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PRKAA2P54646 552 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TRAM2Q15035 370 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms