RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549039.5

CTDSP2-205, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTDSP2, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-205ENST00000549039 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 TTC13Q8NBP0 860 aa11.7□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 OR2Y1Q8NGV0 311 aa11.7□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 CFAP61Q8NHU2 1237 aa11.7□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 TM9SF4Q92544 642 aa11.7□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 ALG3Q92685 438 aa11.7□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 PTERQ96BW5 349 aa11.7□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 GBP5Q96PP8 586 aa11.7□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 TTC1Q99614 292 aa11.7□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 TMEM121Q9BTD3 319 aa11.7□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 ASF1BQ9NVP2 202 aa11.7□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 P4HTMQ9NXG6 502 aa11.7□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 CIDEBQ9UHD4 219 aa11.7□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 SRPK3Q9UPE1 567 aa11.7□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 PLCL2Q9UPR0 1127 aa11.7□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 KLHL20Q9Y2M5 609 aa11.7□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 CCDC162PA2VCL2 907 aa11.69□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 PSMD3O43242 534 aa11.69□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 OR1I1O60431 355 aa11.69□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 KLHL41O60662 606 aa11.69□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 AP2A1O95782 977 aa11.69□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 DDAH2O95865 285 aa11.69□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 ITGA3P26006 1051 aa11.69□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 ACADLP28330 430 aa11.69□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 HSPA14Q0VDF9 509 aa11.69□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 MYBPC3Q14896 1274 aa11.69□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa11.69□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 TTLL10Q6ZVT0 673 aa11.69□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 PEX26Q7Z412 305 aa11.69□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 LINC00523Q86TU6 105 aa11.69□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 TAX1BP1Q86VP1 789 aa11.69□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 ZADH2Q8N4Q0 377 aa11.69□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 UBL4BQ8N7F7 174 aa11.69□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 OR52K1Q8NGK4 314 aa11.69□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa11.69□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 CDC23Q9UJX2 597 aa11.69□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 AMFRQ9UKV5 643 aa11.69□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC5A10A0PJK1 596 aa11.68□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 GRID2IPA4D2P6 1211 aa11.68□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 ANKUB1A6NFN9 424 aa11.68□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 MROH6A6NGR9 719 aa11.68□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 E7EVH7 732 aa11.68□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 F8W8V4 182 aa11.68□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 H3BMH7 237 aa11.68□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 IPO13O94829 963 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 TPBGLP0DKB5 382 aa11.68□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 MAGP20916 626 aa11.68□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 COL8A1P27658 744 aa11.68□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 KIR2DS3Q14952 304 aa11.68□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC5A12Q1EHB4 618 aa11.68□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa11.68□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 PACS1Q6VY07 963 aa11.68□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa11.68□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa11.68□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 KIAA1328Q86T90 577 aa11.68□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 DNAJC22Q8N4W6 341 aa11.68□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 ACRBPQ8NEB7 543 aa11.68□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 OR6P1Q8NGX9 317 aa11.68□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa11.68□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 HDAC10Q969S8 669 aa11.68□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 C5orf34Q96MH7 638 aa11.68□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 TSSK1BQ9BXA7 367 aa11.68□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 LACRTQ9GZZ8 138 aa11.68□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 EURLQ9NYK6 297 aa11.68□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 TEX15Q9BXT5 2789 aa11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 HEATR9A2RTY3 570 aa11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 AGPSO00116 658 aa11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 ALOX12BO75342 701 aa11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 CBX6O95503 412 aa11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 FTCDO95954 541 aa11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 GOT2P00505 430 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 RPN2P04844 631 aa11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 UMODP07911 640 aa11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 FOXN2P32314 431 aa11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 GRIA3P42263 894 aa11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 GABRA4P48169 554 aa11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 RAB28P51157 221 aa11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 CDH17Q12864 832 aa11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 SF1Q15637 639 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF787Q6DD87 383 aa11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 AFTPHQ6ULP2 937 aa11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 TMEM151BQ8IW70 566 aa11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms