RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544999.2

HOXD8-204, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-204ENST00000544999 ISM1B1AKI9 464 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 KATNA1O75449 491 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 USP1O94782 785 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 RECKO95980 971 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 CCR10P46092 362 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 GPS2Q13227 327 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 PTK6Q13882 451 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 GRB7Q14451 532 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF789Q5FWF6 425 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 TTC23LQ6PF05 361 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 CENPUQ71F23 418 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 TRIM73Q86UV7 250 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 SLCO2A1Q92959 643 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 TCTN2Q96GX1 697 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 SIGLEC10Q96LC7 697 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 GPR87Q9BY21 358 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 PCYOX1Q9UHG3 505 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 CRYL1Q9Y2S2 319 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 B8ZZF3 427 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 E7EQ34 232 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 RASGRF2O14827 1237 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 NIPSNAP2O75323 286 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 CREG1O75629 220 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 PKMP14618 531 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 CYP2A7P20853 494 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 CD9P21926 228 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 ATP5DP30049 168 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 ITGA1P56199 1179 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 POLE2P56282 527 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 GNG11P61952 73 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 GBX1Q14549 363 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF470Q6ECI4 717 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 PCGF5Q86SE9 256 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF605Q86T29 641 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 LMNTD2Q8IXW0 634 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 DSELQ8IZU8 1212 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 SLC38A9Q8NBW4 561 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 OR2L8Q8NGY9 312 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 SLC22A18Q96BI1 424 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 FOPNLQ96NB1 174 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 FAM117AQ9C073 453 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 FAM60AQ9NP50 221 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 STARD5Q9NSY2 213 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 ASIC3Q9UHC3 531 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 TUBD1Q9UJT1 453 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 SPTBP11277 2137 aa16.33■□□□□ 0.21
HOXD8-204ENST00000544999 MEN1O00255 615 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 C1orf105O95561 183 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 S1PR4O95977 384 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 HBQ1P09105 142 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 CHRM3P20309 590 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 PTPN4P29074 926 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 RORAP35398 523 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 CCNFP41002 786 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 GABRA4P48169 554 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 RPS15P62841 145 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 ERV3-1Q14264 604 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 ZIC1Q15915 447 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 LONRF1Q17RB8 773 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 DEFB109BQ30KR1 87 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 IZUMO3Q5VZ72 239 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 LINC01555Q8NAE3 123 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 CALML6Q8TD86 181 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 MAGEC3Q8TD91 643 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 SEC14L1Q92503 715 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 MR1Q95460 341 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 RAD51AP1Q96B01 352 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 CLIP3Q96DZ5 547 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 RUNDC3BQ96NL0 473 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 IL17FQ96PD4 163 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 ACTL8Q9H568 366 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 SLC39A10Q9ULF5 831 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 PYCARDQ9ULZ3 195 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 POLHQ9Y253 713 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 NFS1Q9Y697 457 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 CTAGE9A4FU28 777 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 E5RI56 91 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 PTGIRP43119 386 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXD8-204ENST00000544999 BDKRB1P46663 353 aa16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms