RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530170.1

RPS3-215, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

TSL 5

Gene RPS3, Length 531 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-215ENST00000530170 HSD3B1P14060 373 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 EPB42P16452 691 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 HSD3B2P26439 372 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 OXTRP30559 389 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 RPS9P46781 194 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 GNPDA1P46926 289 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 CCR3P51677 355 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 ZP2Q05996 745 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 E2F2Q14209 437 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 NRF1Q16656 503 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 AP5B1Q2VPB7 878 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 MYLK3Q32MK0 819 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 RFX4Q33E94 735 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 RABL3Q5HYI8 236 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 BRAT1Q6PJG6 821 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 SPRED2Q7Z698 418 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 AMIGO2Q86SJ2 522 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 CALHM3Q86XJ0 350 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 EID3Q8N140 333 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 DTWD1Q8N5C7 304 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 PJA1Q8NG27 643 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 GTF2H4Q92759 462 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 OTUB2Q96DC9 234 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 VWCEQ96DN2 955 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 COPS8Q99627 209 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 DOK1Q99704 481 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 SPATA9Q9BWV2 254 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 UGT2B28Q9BY64 529 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 SLC32A1Q9H598 525 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 LRTM1Q9HBL6 345 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 C1orf109Q9NX04 203 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 ELOVL2Q9NXB9 296 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 MARK1Q9P0L2 795 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 CDH7Q9ULB5 785 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 OAZ3Q9UMX2 235 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 IRAK3Q9Y616 596 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 CEPT1Q9Y6K0 416 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 ZNF318Q5VUA4 2279 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 BRWD1Q9NSI6 2320 aa8.96□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 NOTCH4Q99466 2003 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 BPTFQ12830 3046 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 TMEM221A6NGB7 291 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 CFAP99D6REC4 459 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 M0R296 226 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 GRM6O15303 877 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 DPM1O60762 260 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 ULK1O75385 1050 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 GMNNO75496 209 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 DNAJB5O75953 348 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 CLDN9O95484 217 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 POP4O95707 220 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 CPNE6O95741 557 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 ALPIP09923 528 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 G6PDP11413 515 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 CKMT2P17540 419 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 AOAHP28039 575 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 HOXA9P31269 272 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 IRS1P35568 1242 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 HNF1BP35680 557 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 MAGEA2P43356 314 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 ALDH3A2P51648 485 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 CLDN8P56748 225 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 GABARAPL2P60520 117 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 ECT2LQ008S8 904 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 MTAPQ13126 283 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 IL18R1Q13478 541 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 DAG1Q14118 895 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 ABRAXAS2Q15018 415 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 CHRNA6Q15825 494 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 PHKG1Q16816 387 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 CYBRD1Q53TN4 286 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 PITRM1Q5JRX3 1037 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 LILRA6Q6PI73 481 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 CRTC1Q6UUV9 634 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 TMEM92Q6UXU6 159 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP8.95□□□□□ -0.981e-24■■□□□ 14.1
RPS3-215ENST00000530170 GAREM2Q75VX8 874 aa8.95□□□□□ -0.98
RPS3-215ENST00000530170 ASCL5Q7RTU5 278 aa8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms