RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524313.1

IGKV1-22-201, Transcript of immunoglobulin kappa variable 1-22 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGKV1-22, Length 326 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF146Q15072 292 aa0.55□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 DLG2Q15700 870 aa0.55□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 NFIL3Q16649 462 aa0.55□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 MEP1AQ16819 746 aa0.55□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa0.55□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 LINC00242Q5T6M2 205 aa0.55□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 MKXQ8IYA7 352 aa0.55□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF540Q8NDQ6 660 aa0.55□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 LINC01006Q8NI28 216 aa0.55□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 GATAD1Q8WUU5 269 aa0.55□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 JDP2Q8WYK2 163 aa0.55□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 TBC1D20Q96BZ9 403 aa0.55□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 DHX58Q96C10 678 aa0.55□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 MTERF3Q96E29 417 aa0.55□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 C10orf90Q96M02 699 aa0.55□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 HES7Q9BYE0 225 aa0.55□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 PANK2Q9BZ23 570 aa0.55□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 A4GALTQ9NPC4 353 aa0.55□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 ASAH2Q9NR71 780 aa0.55□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 P4HTMQ9NXG6 502 aa0.55□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 HSPB7Q9UBY9 170 aa0.55□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 OSGIN1Q9UJX0 560 aa0.55□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 USP24Q9UPU5 2620 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 CACNA1AO00555 2505 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 PCNX2A6NKB5 2137 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 TAF4O00268 1085 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 ATP2A1O14983 1001 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 PLPP2O43688 288 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF217O75362 1048 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 GJB3O75712 270 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 STAM2O75886 525 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 LYPD3O95274 346 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 MT-ND1P03886 318 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 CD5P06127 495 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 COX7A2P14406 83 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 RPS2P15880 293 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 TNFAIP3P21580 790 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 ACHEP22303 614 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 RBMXP38159 391 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 RIDAP52758 137 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 CSNK2BP67870 215 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 TDGQ13569 410 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 ITGA7Q13683 1181 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 GSTA3Q16772 222 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 ADCK5Q3MIX3 580 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 GCNT6Q5T4J0 391 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 LEMD1Q68G75 181 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 CCDC174Q6PII3 467 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 OR10G7Q8NGN6 311 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 OR1L3Q8NH93 324 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 SPPL2AQ8TCT8 520 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 AFAP1L1Q8TED9 768 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 KIF1BPQ96EK5 621 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 SGCZQ96LD1 299 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 SPAG5Q96R06 1193 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 TWSG1Q9GZX9 223 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 HCN3Q9P1Z3 774 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 CACNG4Q9UBN1 327 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 CLIC4Q9Y696 253 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 NLRC5Q86WI3 1866 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa0.54□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 A0A087WV62 115 aa0.53□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa0.53□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 H0YAE9 185 aa0.53□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 MAP2K7O14733 419 aa0.53□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 CAND2O75155 1236 aa0.53□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 CEACAM4O75871 244 aa0.53□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 CDK2AP2O75956 126 aa0.53□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 NKX2-2O95096 273 aa0.53□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 ICAM1P05362 532 aa0.53□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 IGHV4-31P0DP07 118 aa0.53□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 GP1BBP13224 206 aa0.53□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 LMO2P25791 158 aa0.53□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 ADD2P35612 726 aa0.53□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 UFM1P61960 85 aa0.53□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 IRX4P78413 519 aa0.53□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 ACY1Q03154 408 aa0.53□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 DMPKQ09013 629 aa0.53□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 GAGE2BQ13066 116 aa0.53□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 EFR3AQ14156 821 aa0.53□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 C16orf72Q14CZ0 275 aa0.53□□□□□ -2.32
IGKV1-22-201ENST00000524313 TNIP1Q15025 636 aa0.53□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms