RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517052.1

RNU6-448P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 448, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-448P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-448P-201ENST00000517052 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 PDCL3Q9H2J4 239 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 CPVLQ9H3G5 476 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 PLK3Q9H4B4 646 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 DNAJC18Q9H819 358 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 JMJD4Q9H9V9 463 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 UBN1Q9NPG3 1134 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 FGF21Q9NSA1 209 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 SMC4Q9NTJ3 1288 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 PAG1Q9NWQ8 432 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 OSER1Q9NX31 292 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 EHD2Q9NZN4 543 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 AMACRQ9UHK6 382 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 TUBE1Q9UJT0 475 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 GRID1Q9ULK0 1009 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 NENFQ9UMX5 172 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 TNNQ9UQP3 1299 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 MTMR6Q9Y217 621 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 PIAS3Q9Y6X2 628 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 LRRK1Q38SD2 2015 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 CHD4Q14839 1912 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 A0A1B0GVC2 190 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 FRMD3A2A2Y4 597 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 HYKKA2RU49 373 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 ANKRD61A6NGH8 418 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 ASB14A6NK59 587 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 PI4K2BG5E9Z4 385 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 XRCC3O43542 346 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 SSX4O60224 188 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 HS6ST1O60243 411 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 OR10H2O60403 315 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 GLRA3O75311 464 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 AVILO75366 819 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 CREG1O75629 220 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 CDK2AP2O75956 126 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 TPPPO94811 219 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 DDHD2O94830 711 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 TMEM63AO94886 807 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 CCNDBP1O95273 360 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 OR2C1O95371 312 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 SEC24AO95486 1093 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 DDX58O95786 925 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 HPRP00739 348 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 MELTFP08582 738 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 GP9P14770 177 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 GABRB1P18505 474 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 PON1P27169 355 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 PIK3R1P27986 724 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 DRD3P35462 400 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 ETV5P41161 510 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 MTHFRP42898 656 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 SUOXP51687 545 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 PDX1P52945 283 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 MAZP56270 477 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 CSNK2BP67870 215 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 GCNT1Q02742 428 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 GUCY2DQ02846 1103 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 CD300CQ08708 224 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 IKQ13123 557 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 MTF1Q14872 753 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 TNIP1Q15025 636 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 HERC3Q15034 1050 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 DLG2Q15700 870 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 TSTQ16762 297 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 HIGD2BQ4VC39 106 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 SPDYCQ5MJ68 293 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 LYSMD4Q5XG99 296 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 KLHL35Q6PF15 583 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 SARM1Q6SZW1 724 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 IGFL3Q6UXB1 125 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 TMEM64Q6YI46 380 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 KIF6Q6ZMV9 814 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 FRRS1Q6ZNA5 592 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 PXKQ7Z7A4 578 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 CPLX4Q7Z7G2 160 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 RTN4RL2Q86UN3 420 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 KCNMB4Q86W47 210 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 COMMD2Q86X83 199 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-448P-201ENST00000517052 CATSPERDQ86XM0 798 aa0.57□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms