RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
SH3BP2-210ENST00000505941 CFAP36Q96G28 342 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP2-210ENST00000505941 TCTN2Q96GX1 697 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP2-210ENST00000505941 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP2-210ENST00000505941 PITPNM3Q9BZ71 974 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP2-210ENST00000505941 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
SH3BP2-210ENST00000505941 KLHL42Q9P2K6 505 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP2-210ENST00000505941 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP2-210ENST00000505941 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP2-210ENST00000505941 VPS26AO75436 327 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 SCRG1O75711 98 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 DLGAP3O95886 979 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 ERVK-10P10266 1014 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 LIFP15018 202 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 ST6GAL1P15907 406 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 UGT2B7P16662 529 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF28P17035 718 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 ELK3P41970 407 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 MC1RQ01726 317 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 GPR19Q15760 415 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 MSS51Q4VC12 460 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 KCNJ9Q92806 393 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 INPP5DQ92835 1189 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 PPM1MQ96MI6 270 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM114A2Q9NRY5 505 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 SNX24Q9Y343 169 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 CHD6Q8TD26 2715 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 A0A0J9YY10 115 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 RASGRF2O14827 1237 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 BANF1O75531 89 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 HAUS5O94927 633 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 C1orf105O95561 183 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 PKLRP30613 574 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC5A12Q1EHB4 618 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF789Q5FWF6 425 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 KIAA0408Q6ZU52 694 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 GPR135Q8IZ08 494 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 OR2L8Q8NGY9 312 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 CERS2Q96G23 380 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 OR2A14Q96R47 310 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 NRTNQ99748 197 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 ERP44Q9BS26 406 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 KLHL25Q9H0H3 589 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 CHMP2BQ9UQN3 213 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 ITPR1Q14643 2758 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 ZFHX4Q86UP3 3567 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM150CB9EJG8 249 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 FANCGO15287 622 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 CATP04040 527 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 NTRK1P04629 796 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 MSL3P1P0C860 447 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 TPBGLP0DKB5 382 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 PVRP15151 417 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 CYP2A7P20853 494 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 DLSTP36957 453 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 STAT5AP42229 794 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 CARSP49589 748 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 MPP1Q00013 466 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 SF1Q15637 639 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 KLHL38Q2WGJ6 581 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 NEK10Q6ZWH5 1172 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 UNC5BQ8IZJ1 945 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 WBP1Q96G27 269 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 SPHK1Q9NYA1 384 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 CIDEBQ9UHD4 219 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 KCND3Q9UK17 655 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 NFS1Q9Y697 457 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 NBEAQ8NFP9 2946 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 TK2O00142 265 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 MATN4O95460 622 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 CBSLP0DN79 551 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 CBSP35520 551 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 HSD17B2P37059 387 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 RPL21P46778 160 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 CLCN7P51798 805 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 C2orf54Q08AI8 447 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 ACSBG2Q5FVE4 666 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-210ENST00000505941 PALM2Q8IXS6 379 aa20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 123.4 ms