RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	MXRA7	P84157	204 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	FMO1	Q01740	532 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	MERTK	Q12866	999 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	MAB21L1	Q13394	359 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	NFYC	Q13952	458 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	FLOT2	Q14254	428 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PTGIS	Q16647	500 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	HFE	Q30201	348 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF699	Q32M78	642 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	RTL4	Q6ZR62	310 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971		Q6ZS46	218 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	IQCH	Q86VS3	1027 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM228A	Q86W67	206 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	MR1	Q95460	341 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SLAMF9	Q96A28	289 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	MYO19	Q96H55	970 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	TOX2	Q96NM4	488 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	VPS35	Q96QK1	796 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ACBD6	Q9BR61	282 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	IL21R	Q9HBE5	538 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PALMD	Q9NP74	551 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	DPP3	Q9NY33	737 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	RNF14	Q9UBS8	474 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	CTSF	Q9UBX1	484 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SIX4	Q9UIU6	781 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PSAT1	Q9Y617	370 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	CIT	O14578	2027 aa		6.64	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A1W2PQU0	124 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A1W2PQY0	241 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	CES2	O00748	559 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC22A1	O15245	554 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ALOX15B	O15296	676 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	INPPL1	O15357	1258 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PI15	O43692	258 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	VPS4B	O75351	444 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM155B	O75949	473 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	KCNK5	O95279	499 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PCCB	P05166	539 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	CALCB	P10092	127 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	FST	P19883	344 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	CYP2A7	P20853	494 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	CCNO	P22674	350 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	RORA	P35398	523 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	KIR3DL2	P43630	455 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ASPA	P45381	313 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ALDH1A3	P47895	512 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ENTPD1	P49961	510 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	CDK7	P50613	346 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	IRAK1	P51617	712 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PLK1	P53350	603 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	CDH4	P55283	916 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	KIAA1024L	P59773	190 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PRPS1	P60891	318 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	RHAG	Q02094	409 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	INCA1	Q0VD86	236 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	OVGP1	Q12889	678 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	STX3	Q13277	289 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	RPS6KA1	Q15418	735 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	BAK1	Q16611	211 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		6.63	□□□□□ -1.35

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