RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 CD68P34810 354 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 CBSP35520 551 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 DENND2CQ68D51 928 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 KIRREL2Q6UWL6 708 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 NEK10Q6ZWH5 1172 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 KATNAL2Q8IYT4 538 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 PSMF1Q92530 271 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 HSPH1Q92598 858 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 IMMP1LQ96LU5 166 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF354BQ96LW1 612 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 OSGIN2Q9Y236 505 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 FAM171A2A8MVW0 826 aa7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 A8MX80 341 aa7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 RASGRF2O14827 1237 aa7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 CCNDBP1O95273 360 aa7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 SLC26A3P40879 764 aa7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 WNT3AP56704 352 aa7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 DSG2Q14126 1118 aa7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 NFE2L1Q14494 772 aa7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 KCNAB1Q14722 419 aa7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 LLGL1Q15334 1064 aa7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 OR11G2Q8NGC1 345 aa7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 DNAJB14Q8TBM8 379 aa7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 CCDC120Q96HB5 630 aa7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 TXLNGQ9NUQ3 528 aa7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 SOHLH2Q9NX45 425 aa7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 ANAPC7Q9UJX3 599 aa7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 H0YIG0 161 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 MAP2K7O14733 419 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 NSG1P42857 185 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 PPP1CAP62136 330 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 ADORA2A-AS1P86434 159 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 MPP1Q00013 466 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 ITKQ08881 620 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 FAM53BQ14153 422 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 EXT1Q16394 746 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 NAPRTQ6XQN6 538 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 RGS9BPQ6ZS82 235 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 KIAA0408Q6ZU52 694 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 NLRP9Q7RTR0 991 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 STYXQ8WUJ0 223 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 DCUN1D1Q96GG9 259 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 TTC25Q96NG3 672 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 FERMT1Q9BQL6 677 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 GPAMQ9HCL2 828 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 KLHL3Q9UH77 587 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 PRKAB1Q9Y478 270 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 MROH6A6NGR9 719 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF839A8K0R7 811 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 BTNL10A8MVZ5 291 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 CA5AP35218 305 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 GLRBP48167 497 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 RAB28P51157 221 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 ADARP55265 1226 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 GBE1Q04446 702 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 COPS8Q99627 209 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 MMP25Q9NPA2 562 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 OR5H15A6NDH6 313 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 SLCO2B1O94956 709 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 RASAL1O95294 804 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 TPBGLP0DKB5 382 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 ACPPP15309 386 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 AGTR2P50052 363 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 ABATP80404 500 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 Q0VFX4 171 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 PTK6Q13882 451 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 KCTD11Q693B1 232 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 PLAG1Q6DJT9 500 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 RCOR2Q8IZ40 523 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 CUTCQ9NTM9 273 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 SEC14L3Q9UDX4 400 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 OR2A25A4D2G3 310 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 AP3B1O00203 1094 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 KRT86O43790 486 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 GPC4O75487 556 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 CDKN2BP42772 138 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 TERF2Q15554 542 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 ZIC1Q15915 447 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 SLC18A3Q16572 532 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-210ENST00000503258 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms