RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493945.5

ACTB-213, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,236 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-213ENST00000493945 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 ANKRD12Q6UB98 2062 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 A0A1W2PPM1 405 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 TRIM38O00635 465 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 TNFSF14O43557 240 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 CCNDBP1O95273 360 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 FKBP9O95302 570 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 AMD1P17707 334 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 GLRBP48167 497 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 GPR18Q14330 331 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 TGFBIQ15582 683 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 PROX2Q3B8N5 592 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 TECRLQ5HYJ1 363 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 SULT1C3Q6IMI6 304 aa14.5□□□□□ -0.09
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ACTB-213ENST00000493945 AMIGO1Q86WK6 493 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 SLC22A9Q8IVM8 553 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 SYTL1Q8IYJ3 562 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 OR52E1Q8NGJ3 308 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 EXT2Q93063 718 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 CAMK1GQ96NX5 476 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 SH3GL2Q99962 352 aa14.5□□□□□ -0.09
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ACTB-213ENST00000493945 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 CPED1A4D0V7 1026 aa14.49□□□□□ -0.09
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ACTB-213ENST00000493945 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
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ACTB-213ENST00000493945 EML2O95834 649 aa14.49□□□□□ -0.09
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ACTB-213ENST00000493945 TGM1P22735 817 aa14.49□□□□□ -0.09
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ACTB-213ENST00000493945 SBSNQ6UWP8 590 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 ZNF438Q7Z4V0 828 aa14.49□□□□□ -0.09
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ACTB-213ENST00000493945 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 BANPQ8N9N5 519 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 PDPRQ8NCN5 879 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 PATE1Q8WXA2 126 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 SMPDL3AQ92484 453 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 FBXL8Q96CD0 374 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 ABCG4Q9H172 646 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 PDE10AQ9Y233 779 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 C2orf74A8MZ97 194 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 SH3BP5O60239 455 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 UBXN7O94888 489 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 GUCA1CO95843 209 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 ACP1P24666 158 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 PKLRP30613 574 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 SLC18A1P54219 525 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 PNLIPRP1P54315 467 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 PRKAA2P54646 552 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
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ACTB-213ENST00000493945 KIR2DS3Q14952 304 aa14.48□□□□□ -0.09
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ACTB-213ENST00000493945 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 XKR5Q6UX68 686 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 EXOC3L1Q86VI1 746 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 PLXDC1Q8IUK5 500 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 HOMEZQ8IX15 550 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 KIAA2013Q8IYS2 634 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 SPATA6LQ8N4H0 392 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 OR2L8Q8NGY9 312 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 HMGCLL1Q8TB92 370 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 IFI44Q8TCB0 444 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 CCDC74AQ96AQ1 378 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 TLCD1Q96CP7 247 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 FAM122AQ96E09 287 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 ZDHHC12Q96GR4 267 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 SELENOSQ9BQE4 189 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 CAPS2Q9BXY5 557 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 STK38LQ9Y2H1 464 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-213ENST00000493945 PLLPQ9Y342 182 aa14.48□□□□□ -0.09
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