RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 CROTQ9UKG9 612 aa5.88□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa5.88□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 A0A087WXM4 84 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 HDAC3O15379 428 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 KATNA1O75449 491 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 METTL18O95568 372 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ESRRBO95718 433 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CHRNGP07510 517 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 GCAP28676 217 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CYP4F3Q08477 520 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 BNIP3Q12983 259 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ADCK2Q7Z695 626 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 GPR156Q8NFN8 814 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 GATA6Q92908 595 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 OR52B2Q96RD2 323 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 FAM129BQ96TA1 746 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PLGRKTQ9HBL7 147 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PARD6AQ9NPB6 346 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 C2P06681 752 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 FASP25445 335 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PGGT1BP53609 377 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 SLC18A1P54219 525 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 SCAPQ12770 1279 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CTBP1Q13363 440 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 NR1D2Q14995 579 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 DPYSL2Q16555 572 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CYP51A1Q16850 503 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 GRTP1Q5TC63 336 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM215Q68D42 235 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 SLC9A4Q6AI14 798 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 SLC9B2Q86UD5 537 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 RASGRP3Q8IV61 690 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 OFCC1Q8IZS5 231 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 LZICQ8WZA0 190 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM159Q96B96 161 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 LRRC39Q96DD0 335 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 OR2M4Q96R27 311 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 NAT9Q9BTE0 207 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 COQ10BQ9H8M1 238 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 NDOR1Q9UHB4 597 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 FADS3Q9Y5Q0 445 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CHD8Q9HCK8 2581 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 LAMA3Q16787 3333 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 HACD1B0YJ81 288 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 TK2O00142 265 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 NDST3O95803 873 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CRABP2P29373 138 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 SLC7A2P52569 658 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PPP2CBP62714 309 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PPP2CAP67775 309 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 NFATC2Q13469 925 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 TCEAL1Q15170 157 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 RBBP7Q16576 425 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 C4orf22Q6V702 233 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 TRIM69Q86WT6 500 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 RNF145Q96MT1 663 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 DACH2Q96NX9 599 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CLPBQ9H078 707 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 OR2AG1Q9H205 316 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ABCG8Q9H221 673 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 RMI1Q9H9A7 625 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 LATS2Q9NRM7 1088 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 SH3GLB1Q9Y371 365 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PI4KAP42356 2102 aa5.87□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ARID2Q68CP9 1835 aa5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 A0A088AWK7 358 aa5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 GSAPA4D1B5 854 aa5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 OR5K4A6NMS3 321 aa5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 BUD23O43709 281 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 DUX1O43812 170 aa5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 MFSD11O43934 449 aa5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 MAN1A2O60476 641 aa5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 DNAJA2O60884 412 aa5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 DLGAP3O95886 979 aa5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 RPN2P04844 631 aa5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 ATP6V1B2P21281 511 aa5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 PTPN3P26045 913 aa5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 CCR10P46092 362 aa5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 WNT3AP56704 352 aa5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 HPCAP84074 193 aa5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-205ENST00000468371 OLIG2Q13516 323 aa5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms