RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444685.1

CBX1-204, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene CBX1, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-204ENST00000444685 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 ZNF449Q6P9G9 518 aa4.97□□□□□ -1.61
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CBX1-204ENST00000444685 CERS6Q6ZMG9 384 aa4.97□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa4.97□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 CHSY3Q70JA7 882 aa4.97□□□□□ -1.61
CBX1-204ENST00000444685 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa4.97□□□□□ -1.61
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CBX1-204ENST00000444685 MMP21Q8N119 569 aa4.97□□□□□ -1.61
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CBX1-204ENST00000444685 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
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CBX1-204ENST00000444685 CDC23Q9UJX2 597 aa4.97□□□□□ -1.61
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CBX1-204ENST00000444685 ACSL5Q9ULC5 683 aa4.97□□□□□ -1.61
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CBX1-204ENST00000444685 BTRCQ9Y297 605 aa4.97□□□□□ -1.61
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CBX1-204ENST00000444685 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
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CBX1-204ENST00000444685 LCN9Q8WX39 176 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 NR4A3Q92570 626 aa4.96□□□□□ -1.62
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CBX1-204ENST00000444685 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
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CBX1-204ENST00000444685 LYSMD1Q96S90 227 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 SLX1AQ9BQ83 275 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 CCM2Q9BSQ5 444 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 NDC1Q9BTX1 674 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 NUP85Q9BW27 656 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 BRINP2Q9C0B6 783 aa4.96□□□□□ -1.62
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