RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 GFYI3L273 518 aa16.32■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 RASGRF2O14827 1237 aa16.32■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 SPAG6O75602 509 aa16.32■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 PKLRP30613 574 aa16.32■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 ACY1Q03154 408 aa16.32■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 ACACAQ13085 2346 aa16.32■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 KIR2DS3Q14952 304 aa16.32■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa16.32■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 RELL1Q8IUW5 271 aa16.32■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 RASGRP3Q8IV61 690 aa16.32■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 RAB42Q8N4Z0 105 aa16.32■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 OR2L8Q8NGY9 312 aa16.32■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 HMGCLL1Q8TB92 370 aa16.32■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 ASB11Q8WXH4 323 aa16.32■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC22A18Q96BI1 424 aa16.32■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 NDNQ99608 321 aa16.32■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 NRTNQ99748 197 aa16.32■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 SPRY4Q9C004 299 aa16.32■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 FOXJ2Q9P0K8 574 aa16.32■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC17A6Q9P2U8 582 aa16.32■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC39A10Q9ULF5 831 aa16.32■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 BTRCQ9Y297 605 aa16.32■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 SSUH2Q9Y2M2 353 aa16.32■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa16.32■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 CATP04040 527 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 MSL3P1P0C860 447 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 FGF5P12034 268 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 CDH3P22223 829 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 ARL4DP49703 201 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 RGS4P49798 205 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 CDKN2DP55273 166 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 GPX6P59796 221 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 TMTC4Q5T4D3 741 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 HECTD2Q5U5R9 776 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 ANKS6Q68DC2 871 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM45BPQ6NSW5 357 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 SPESP1Q6UW49 350 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 STRA8Q7Z7C7 330 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC25Q86WR0 208 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 DTX1Q86Y01 620 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM45AQ8TCE6 357 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 KCNE4Q8WWG9 221 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 FCRL4Q96PJ5 515 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 OR2A14Q96R47 310 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 MCMBPQ9BTE3 642 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 SYTL2Q9HCH5 934 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 SMYD2Q9NRG4 433 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 SPHK1Q9NYA1 384 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 SPATA7Q9P0W8 599 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 PLAGL1Q9UM63 463 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 PSAT1Q9Y617 370 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 ASPMQ8IZT6 3477 aa16.31■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM159BA6NKW6 160 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 MYO1CO00159 1063 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 MAP3K7O43318 606 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 ZBTB14O43829 449 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 FKBP9O95302 570 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 C1QAP02745 245 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 LIPCP11150 499 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 FOLR1P15328 257 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 UGT2B7P16662 529 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 FDXRP22570 491 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 HSD17B2P37059 387 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 SH3BP2P78314 561 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 FOXM1Q08050 763 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 CUL1Q13616 776 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 ARHGAP19Q14CB8 494 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 CYP2A13Q16696 494 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC5A12Q1EHB4 618 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 PAQR3Q6TCH7 311 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 CPNE9Q8IYJ1 553 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 GPATCH11Q8N954 259 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 LINC01555Q8NAE3 123 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 OR9A1PQ8NGU1 263 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 PMEPA1Q969W9 287 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 PPM1MQ96MI6 270 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 DCBLD2Q96PD2 775 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 OR6C1Q96RD1 312 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 RHOJQ9H4E5 214 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 L2HGDHQ9H9P8 463 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 APMAPQ9HDC9 416 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 PDE7BQ9NP56 450 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 ARHGEF33A8MVX0 844 aa16.29■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 ISM1B1AKI9 464 aa16.29■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 STMND1H3BQB6 276 aa16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms