RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 PRAMEP78395 509 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 GUCY2DQ02846 1103 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 CACNG1Q06432 222 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 IL10RAQ13651 578 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 LAMB3Q13751 1172 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 NFE2L1Q14494 772 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 GPR33Q49SQ1 333 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 TSTD2Q5T7W7 516 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 SERPINA9Q86WD7 417 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 OTUD6BQ8N6M0 293 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 MAP3K3Q99759 626 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 HRASLS2Q9NWW9 162 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 TCFL5Q9UL49 500 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 SNX24Q9Y343 169 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 NEU2Q9Y3R4 380 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 TCAF1Q9Y4C2 921 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 CELSR2Q9HCU4 2923 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 UQCRHLA0A096LP55 91 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 CCDC162PA2VCL2 907 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 MROH6A6NGR9 719 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 GOLGA8MH3BSY2 632 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 MEN1O00255 615 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 GOT2P00505 430 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 POLBP06746 335 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 UQCRHP07919 91 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 HBQ1P09105 142 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 AGXTP21549 392 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 ACRV1P26436 265 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 MGAT1P26572 445 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 NDUFS1P28331 727 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 DCTP40126 519 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 PER3P56645 1201 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 CHAF1BQ13112 559 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 KCNAB1Q14722 419 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 RPE65Q16518 533 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 SLC6A19Q695T7 634 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 CASC4Q6P4E1 433 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 AFTPHQ6ULP2 937 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 C11orf96Q7Z7L8 435 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 TICAM1Q8IUC6 712 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 FDCSPQ8NFU4 85 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 HDAC10Q969S8 669 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 CLIP3Q96DZ5 547 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 MOCOSQ96EN8 888 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 ZNF778Q96MU6 729 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 ERP44Q9BS26 406 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 DHRS4Q9BTZ2 278 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 CHST8Q9H2A9 424 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 RUBCNLQ9H714 662 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 CHRAC1Q9NRG0 131 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 BFARQ9NZS9 450 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 ACSL5Q9ULC5 683 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 BTRCQ9Y297 605 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 WDR37Q9Y2I8 494 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 WIPF3A6NGB9 483 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 H7C0S8 307 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 CTIFO43310 598 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 LDLRP01130 860 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 SLC35G4P0C7Q5 338 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 MSL3P1P0C860 447 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 TPSB2P20231 275 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 RPL21P46778 160 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 SARNPP82979 210 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 GPS2Q13227 327 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 KRT33BQ14525 404 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 TPSAB1Q15661 275 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 DBN1Q16643 649 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 BCL7AQ4VC05 210 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 PCID2Q5JVF3 399 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 ANKRD22Q5VYY1 191 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 DUPD1Q68J44 220 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 NLRP9Q7RTR0 991 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 IFT20Q8IY31 132 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 PIANPQ8IYJ0 282 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 CFAP206Q8IYR0 622 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-210ENST00000442481 DSELQ8IZU8 1212 aa11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms