RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 MPSTP25325 297 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 PRDX6P30041 224 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 PREPP48147 710 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 AGTR2P50052 363 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 DMTNQ08495 405 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 MTAPQ13126 283 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 KRT33BQ14525 404 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 PTCHD3Q3KNS1 767 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 WDR45BQ5MNZ6 344 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 KANK2Q63ZY3 851 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 CRTC3Q6UUV7 619 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 GCNT7Q6ZNI0 430 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 FAM9CQ8IZT9 166 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 HMGCLL1Q8TB92 370 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 DNASE2BQ8WZ79 361 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 UBE2E3Q969T4 207 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 REPS1Q96D71 796 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 CMTM5Q96DZ9 223 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 NSL1Q96IY1 281 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 HHIPQ96QV1 700 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 PKP4Q99569 1192 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 GSDMCQ9BYG8 508 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 ZBTB26Q9HCK0 441 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 GPR27Q9NS67 375 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 NMRK1Q9NWW6 199 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 ADGRE2Q9UHX3 823 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 MOSPD1Q9UJG1 213 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 OR7A17O14581 309 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 RGS14O43566 566 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 FUCA1P04066 466 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 ERGP11308 486 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 ACP5P13686 325 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 LBPP18428 481 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 AOC1P19801 751 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 CXCR2P25025 360 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 CD38P28907 300 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 SERPINB3P29508 390 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 HMOX2P30519 316 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 CNR2P34972 360 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 DPP6P42658 865 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 GNPDA1P46926 289 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 ATP4BP51164 291 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 CLDN2P57739 230 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 BTKQ06187 659 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 E2F2Q14209 437 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 CYP2A13Q16696 494 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 GSTA3Q16772 222 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 PAGE2BQ5JRK9 111 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 ATG14Q6ZNE5 492 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 CHSY3Q70JA7 882 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 TRIM46Q7Z4K8 759 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 CLNKQ7Z7G1 428 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 OR4F6Q8NGB9 312 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 GPBAR1Q8TDU6 330 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 SMPDL3AQ92484 453 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 WDR34Q96EX3 536 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 PPP3R2Q96LZ3 170 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 FERD3LQ96RJ6 166 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM79Q9BSE2 394 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 SGPP1Q9BX95 441 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 NUF2Q9BZD4 464 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 MUTYHQ9UIF7 546 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 DYRK1BQ9Y463 629 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 BPTFQ12830 3046 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa9.33□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 A0A0G2JNG1 304 aa9.33□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ERICH4A6NGS2 130 aa9.33□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 E7ENX8 843 aa9.33□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 NPIPB8E9PQR5 432 aa9.33□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 K7ESF4 209 aa9.33□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 KIR2DS3K7RE56 304 aa9.33□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 SDHDO14521 159 aa9.33□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 FCHO1O14526 889 aa9.33□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 UBDO15205 165 aa9.33□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 WFS1O76024 890 aa9.33□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 OR4F21O95013 312 aa9.33□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 FKBP9O95302 570 aa9.33□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 SLC16A8O95907 504 aa9.33□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 THEGLP0DJG4 465 aa9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.6 ms