RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 GRB7Q14451 532 aa24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 GBX1Q14549 363 aa24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 GPR19Q15760 415 aa24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 CCSMST1Q4G0I0 132 aa24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 TMTC4Q5T4D3 741 aa24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 IL22RA1Q8N6P7 574 aa24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 NDNQ99608 321 aa24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 GPR21Q99679 349 aa24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 ULBP3Q9BZM4 244 aa24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 SPRY4Q9C004 299 aa24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 PDE7BQ9NP56 450 aa24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 FGF21Q9NSA1 209 aa24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 RARRES3Q9UL19 164 aa24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 MED16Q9Y2X0 877 aa24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 SPAG6O75602 509 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 C1orf105O95561 183 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 FGF5P12034 268 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 GABRB3P28472 473 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 PKLRP30613 574 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 RAB28P51157 221 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 ACY1Q03154 408 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 CUL1Q13616 776 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 KLHL38Q2WGJ6 581 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 STEAP4Q687X5 459 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 SPESP1Q6UW49 350 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 TAX1BP1Q86VP1 789 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 PPP1R3BQ86XI6 285 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 CARFQ8N187 725 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 GIMAP7Q8NHV1 300 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 OR2A14Q96R47 310 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 GRHL1Q9NZI5 618 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC39A10Q9ULF5 831 aa24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 KIAA0754O94854 1291 aa24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 AHSGP02765 367 aa24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 VAC14Q08AM6 782 aa24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 TRADDQ15628 312 aa24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 TTLL9Q3SXZ7 439 aa24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM20CQ8IXL6 584 aa24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 ZBED8Q8IZ13 594 aa24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 KCNJ9Q92806 393 aa24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 INPP5DQ92835 1189 aa24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 RAD51AP1Q96B01 352 aa24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 MENTQ9BUN1 341 aa24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 PITPNM3Q9BZ71 974 aa24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 BTRCQ9Y297 605 aa24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 DHRS7Q9Y394 339 aa24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 COMMD10Q9Y6G5 202 aa24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 E7ESA3 106 aa24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 TIAF1O95411 115 aa24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 CD9P21926 228 aa24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 ATP5DP30049 168 aa24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 PLTPP55058 493 aa24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC7A5Q01650 507 aa24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 CAPN12Q6ZSI9 719 aa24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 GPR155Q7Z3F1 870 aa24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 CNTN4Q8IWV2 1026 aa24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 NLGN4XQ8N0W4 816 aa24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 LINC01555Q8NAE3 123 aa24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 RAB17Q9H0T7 212 aa24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 SAYSD1Q9NPB0 183 aa24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 SPTBP11277 2137 aa24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 RASGRF2O14827 1237 aa24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 MAP3K7O43318 606 aa24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 VPS26AO75436 327 aa24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 MATN4O95460 622 aa24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 CCNFP41002 786 aa24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 TUBB4BP68371 445 aa24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 TUBB2AQ13885 445 aa24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 CYB5D1Q6P9G0 228 aa24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 GALNT6Q8NCL4 622 aa24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 TUBB2BQ9BVA1 445 aa24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 MRFAP1Q9Y605 127 aa24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 K7ENP7 123 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 DLGAP3O95886 979 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 NTRK1P04629 796 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 WT1P19544 449 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 KIR2DS3Q14952 304 aa24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1-202ENST00000425695 KIAA0408Q6ZU52 694 aa24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms