RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPARCL1Q14515 664 aa12.69□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DBN1Q16643 649 aa12.69□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa12.69□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TLDC1Q6P9B6 456 aa12.69□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAS2R42Q7RTR8 314 aa12.69□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNGA4Q8IV77 575 aa12.69□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa12.69□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC110Q8TBZ0 833 aa12.69□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC45Q96CN5 670 aa12.69□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa12.69□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IRAK4Q9NWZ3 460 aa12.69□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR6C2Q9NZP2 312 aa12.69□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD12Q6UB98 2062 aa12.69□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CROCCQ5TZA2 2017 aa12.68□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AGPSO00116 658 aa12.68□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITGA3P26006 1051 aa12.68□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTNNA2P26232 953 aa12.68□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACADLP28330 430 aa12.68□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAGEA1P43355 309 aa12.68□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COPS2P61201 443 aa12.68□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CACNG1Q06432 222 aa12.68□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC5A12Q1EHB4 618 aa12.68□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM151BQ8IW70 566 aa12.68□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa12.68□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIANPQ8IYJ0 282 aa12.68□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBC1D21Q8IYX1 336 aa12.68□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR5K2Q8NHB8 316 aa12.68□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP4R1Q8TF05 950 aa12.68□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELMO1Q92556 727 aa12.68□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM118BQ9BPY3 351 aa12.68□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDC1Q9BTX1 674 aa12.68□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa12.68□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa12.68□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLG2Q9UHN1 485 aa12.68□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLCL2Q9UPR0 1127 aa12.68□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSAG2Q9Y5P2 127 aa12.68□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRSS21Q9Y6M0 314 aa12.68□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLEQ07864 2286 aa12.67□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 QSOX1O00391 747 aa12.67□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FTH1P02794 183 aa12.67□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TPBGLP0DKB5 382 aa12.67□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTPN7P35236 360 aa12.67□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NSG1P42857 185 aa12.67□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GCGRP47871 477 aa12.67□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYTL3Q4VX76 610 aa12.67□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1QL3Q5VWW1 255 aa12.67□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMTC1Q8IUR5 882 aa12.67□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAJC22Q8N4W6 341 aa12.67□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NACC2Q96BF6 587 aa12.67□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa12.67□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OSBPL8Q9BZF1 889 aa12.67□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC6A20Q9NP91 592 aa12.67□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC22A11Q9NSA0 550 aa12.67□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXL4Q9UKA2 621 aa12.67□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLAGL1Q9UM63 463 aa12.67□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TFR2Q9UP52 801 aa12.67□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EFR3BQ9Y2G0 817 aa12.67□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ISM1B1AKI9 464 aa12.66□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 E2F3O00716 465 aa12.66□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALOX12BO75342 701 aa12.66□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AP2A1O95782 977 aa12.66□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAGP20916 626 aa12.66□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MMP11P24347 488 aa12.66□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITIH4Q14624 930 aa12.66□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POU6F1Q14863 301 aa12.66□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIR2DS3Q14952 304 aa12.66□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BRD3Q15059 726 aa12.66□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIF1AQ16665 826 aa12.66□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCTD11Q693B1 232 aa12.66□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PACS1Q6VY07 963 aa12.66□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STYXQ8WUJ0 223 aa12.66□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DLG3Q92796 817 aa12.66□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FKBP10Q96AY3 582 aa12.66□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EURLQ9NYK6 297 aa12.66□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DOCK10Q96BY6 2186 aa12.66□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1B0GX78 115 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC5A10A0PJK1 596 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC78A2IDD5 438 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KDM1AO60341 852 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TPH1P17752 444 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITGAXP20702 1163 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALAS2P22557 587 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MSNP26038 577 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNFRSF8P28908 595 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PKLRP30613 574 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSFMP43897 325 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARSFP54793 590 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa12.65□□□□□ -0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGFL2Q6UWQ7 119 aa12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms