RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417027.1

RPS3AP9-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 9, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP9, Length 792 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP9-201ENST00000417027 DLK1P80370 383 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 HTD2P86397 168 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 PRKCZQ05513 592 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 GPR18Q14330 331 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 TWIST1Q15672 202 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 FUT11Q495W5 492 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF789Q5FWF6 425 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 WASHC2DQ5SRD0 308 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 GCNT6Q5T4J0 391 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 PARM1Q6UWI2 310 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 C4orf19Q8IY42 314 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 NRACQ8N912 160 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 CLEC1AQ8NC01 280 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 KIAA0895Q8NCT3 520 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF540Q8NDQ6 660 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR52E1Q8NGJ3 308 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR52I2Q8NH67 350 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR5R1Q8NH85 324 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 SEMA4DQ92854 862 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 PANX3Q96QZ0 392 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 CSF3RQ99062 836 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 SLC2A11Q9BYW1 496 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 ISCUQ9H1K1 167 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 PNPLA3Q9NST1 481 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 COMMD8Q9NX08 183 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 TAS2R3Q9NYW6 316 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 AURKCQ9UQB9 309 aa3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 HEG1Q9ULI3 1381 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 A0A1W2PP11 408 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 hDV102S1A0JD36 115 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 HYKKA2RU49 373 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 MS4A18H0YCH9 400 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 H0YIG0 161 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 PLOD2O00469 737 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 NTN1O95631 604 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 LCATP04180 440 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 HEXBP07686 556 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 TMEM191BP0C7N4 346 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 SMIM18P0DKX4 95 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 PRF1P14222 555 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 ETS1P14921 441 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 NAGAP17050 411 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 CTSCP53634 463 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 MFAP3P55082 362 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 GALK2Q01415 458 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 GCNT1Q02742 428 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 GAGE2BQ13066 116 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 PRKAA1Q13131 559 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 MTX1Q13505 466 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 CUL3Q13618 768 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 MAPK11Q15759 364 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 WSCD2Q2TBF2 565 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 ODF3L2Q3SX64 289 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 GAGE2EQ4V326 116 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 GAGE2AQ6NT46 116 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 NOTUMQ6P988 496 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 OLFM4Q6UX06 510 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 BTNL8Q6UX41 500 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 MFSD7Q6UXD7 560 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 Q6ZTK2 550 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 C1orf186Q6ZWK4 172 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF410Q86VK4 478 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 LCA5Q86VQ0 697 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 MAP7D3Q8IWC1 876 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 CNNM3Q8NE01 707 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 IPMKQ8NFU5 416 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 KIAA1524Q8TCG1 905 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 PPP4R1Q8TF05 950 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 SSMEM1Q8WWF3 244 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 OIT3Q8WWZ8 545 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 MTERF3Q96E29 417 aa3.95□□□□□ -1.78
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF560Q96MR9 790 aa3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms