RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-210	ENST00000415055	EPHA3	P29320	983 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	ETV5	P41161	510 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	PIK3CA	P42336	1068 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	TKTL1	P51854	596 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	THOP1	P52888	689 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	PDX1	P52945	283 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	KLRB1	Q12918	225 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	FZD2	Q14332	565 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	ZNF284	Q2VY69	593 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	FSCB	Q5H9T9	825 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	PARG	Q86W56	976 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	UNC93A	Q86WB7	457 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	HORMAD1	Q86X24	394 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	APCDD1	Q8J025	514 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	RBFA	Q8N0V3	343 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	ZG16B	Q96DA0	208 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	EPSTI1	Q96J88	318 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	COG8	Q96MW5	612 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	TIGD1	Q96MW7	591 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	CATSPER2	Q96P56	530 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	SERINC2	Q96SA4	455 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	CMKLR1	Q99788	373 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	DUSP16	Q9BY84	665 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	PANK2	Q9BZ23	570 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	VPS16	Q9H269	839 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	SPAST	Q9UBP0	616 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	DAPP1	Q9UN19	280 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	RTTN	Q86VV8	2226 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	DYTN	A2CJ06	578 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055		M0QYT0	321 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	FPGT	O14772	594 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	DHH	O43323	396 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	ACSL4	O60488	711 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	GUCY1B2	O75343	617 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	GCAT	O75600	419 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	PRSS23	O95084	383 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	VNN1	O95497	513 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	LATS1	O95835	1130 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	PRKCG	P05129	697 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	RNF224	P0DH78	156 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	TNNT1	P13805	278 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	LIF	P15018	202 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	PDGFRA	P16234	1089 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	CD82	P27701	267 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	GJB2	P29033	226 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	SERPINA4	P29622	427 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	STAT6	P42226	847 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	RABIF	P47224	123 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	MAN2A2	P49641	1150 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	NR1H2	P55055	460 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	TAS2R38	P59533	333 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	ADIG	Q0VDE8	80 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRK-210	ENST00000415055	SGCG	Q13326	291 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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