RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409937.1

CNGA3-204, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CNGA3, Length 2,615 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-204ENST00000409937 CDC26Q8NHZ8 85 aa13.77□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 RAB2BQ8WUD1 216 aa13.77□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 PPP3R2Q96LZ3 170 aa13.77□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 SLC22A12Q96S37 553 aa13.77□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 TUBA1CQ9BQE3 449 aa13.77□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 ACPTQ9BZG2 426 aa13.77□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 INIPQ9NRY2 104 aa13.77□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 SH3GLB1Q9Y371 365 aa13.77□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 A0A1B0GVM2 712 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 MANBAO00462 879 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 PFDN6O15212 129 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 INPPL1O15357 1258 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 EOMESO95936 686 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 NPPAP01160 153 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 IMPDH2P12268 514 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 OR1D2P34982 312 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 ISL1P61371 349 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 RELAQ04206 551 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 TCTN1Q2MV58 587 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 C5orf22Q49AR2 442 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 RUNDC3AQ59EK9 446 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 TTC23Q5W5X9 447 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 LEMD2Q8NC56 503 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 MYO19Q96H55 970 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 GORASP2Q9H8Y8 452 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 IL26Q9NPH9 171 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 TMEM9Q9P0T7 183 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 VPS51Q9UID3 782 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 PPT2Q9UMR5 302 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 ZBBXA8MT70 800 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 BCKDKO14874 412 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 SEC24AO95486 1093 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 PDYNP01213 254 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 CSKP41240 450 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 GNPDA1P46926 289 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 VBP1P61758 197 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 CHRNA6Q15825 494 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 CYP4Z1Q86W10 505 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 APCDD1Q8J025 514 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 ZFP90Q8TF47 636 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 MUL1Q969V5 352 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 NRBF2Q96F24 287 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 CCDC115Q96NT0 180 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 FEM1AQ9BSK4 669 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 CD244Q9BZW8 370 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 CLMPQ9H6B4 373 aa13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 PCMT1P22061 227 aa13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 HECTD3Q5T447 861 aa13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 CACHD1Q5VU97 1274 aa13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 ANKS3Q6ZW76 656 aa13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 VTCN1Q7Z7D3 282 aa13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 CHPFQ8IZ52 775 aa13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 EID3Q8N140 333 aa13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 MCOLN3Q8TDD5 553 aa13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 SPATA17Q96L03 361 aa13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 NODALQ96S42 347 aa13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 SERHLQ9NQF3 203 aa13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 TBCCD1Q9NVR7 557 aa13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 SNX5Q9Y5X3 404 aa13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 TMEM247A6NEH6 219 aa13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 ADAM23O75077 832 aa13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 SULT1C4O75897 302 aa13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 EPORP19235 508 aa13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 CD97P48960 835 aa13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 BCAP31P51572 246 aa13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 NFATC2Q13469 925 aa13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 CTF1Q16619 201 aa13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 ZSWIM9Q86XI8 627 aa13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 ZBTB2Q8N680 514 aa13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 ARL10Q8N8L6 244 aa13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 TERB1Q8NA31 727 aa13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 FBXO22Q8NEZ5 403 aa13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 PIH1D2Q8WWB5 315 aa13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 POLE4Q9NR33 117 aa13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 RASSF1Q9NS23 344 aa13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
CNGA3-204ENST00000409937 CRLS1Q9UJA2 301 aa13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms