RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405546.7

ATG4B-206, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 3,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-206ENST00000405546 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 CPNE6O95741 557 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 SLC10A3P09131 477 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 DBTP11182 482 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 RAB15P59190 212 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 BNIP2Q12982 314 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 PTGR1Q14914 329 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 ARMC12Q5T9G4 340 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 SERPINA9Q86WD7 417 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 AQP12AQ8IXF9 295 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 CD200R1Q8TD46 325 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 FKBP10Q96AY3 582 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 CENPOQ9BU64 300 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 IL37Q9NZH6 218 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 VPS4BO75351 444 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 CLK3P49761 638 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 PHC1P78364 1004 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 KCNAB2Q13303 367 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 CTF1Q16619 201 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 CTSL3PQ5NE16 218 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 SPATA19Q7Z5L4 167 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 MINDY1Q8N5J2 469 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 NODALQ96S42 347 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 ZBTB18Q99592 522 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 PDFQ9HBH1 243 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 AMBNQ9NP70 447 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 AKIP1Q9NQ31 210 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 RASSF1Q9NS23 344 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 LIMD1Q9UGP4 676 aa14.72□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 RAD51BO15315 384 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 AOC2O75106 756 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 SH3BGRLO75368 114 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 DNTTP04053 509 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 GSNP06396 782 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 ERVK-8P63133 956 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 C6orf141Q5SZD1 244 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 DESI1Q6ICB0 168 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 ENPP6Q6UWR7 440 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 DET1Q7L5Y6 550 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 PACRGLQ8N7B6 248 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 CD99L2Q8TCZ2 262 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 TRIB3Q96RU7 358 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 BDH2Q9BUT1 245 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 PRRG3Q9BZD7 231 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 A0A1W2PQY0 241 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 NBNO60934 754 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 SELPP16109 830 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 ATP4BP51164 291 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 ACVR1Q04771 509 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 GTF2H2Q13888 395 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 VEPH1Q14D04 833 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 TYSND1Q2T9J0 566 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 LRIT3Q3SXY7 679 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 TXNDC8Q6A555 127 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 PLD3Q8IV08 490 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 ITFG1Q8TB96 612 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 TMEM125Q96AQ2 219 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 CEP295NLQ96MC4 621 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 BEX2Q9BXY8 128 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 NTN4Q9HB63 628 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 AIG1Q9NVV5 245 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 SARDHQ9UL12 918 aa14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 MYLKQ15746 1914 aa14.71□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 ILVBLA1L0T0 632 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 CCNKO75909 580 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 KCNK2O95069 426 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 CLDN7O95471 211 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 VNN2O95498 520 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 CKMP06732 381 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 IL12AP29459 219 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 RGS4P49798 205 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 ARF5P84085 180 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 ABRAXAS2Q15018 415 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 FAM209AQ5JX71 171 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 ARMC8Q8IUR7 673 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 ATL1Q8WXF7 558 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 UBE2FQ969M7 185 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms