RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 PHKG1Q16816 387 aa5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 XKR7Q5GH72 579 aa5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 AGBL4Q5VU57 503 aa5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 SULT1C3Q6IMI6 304 aa5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 FBXL19Q6PCT2 694 aa5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 XKR5Q6UX68 686 aa5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 SYVN1Q86TM6 617 aa5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 TEX9Q8N6V9 391 aa5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 OR56A4Q8NGH8 313 aa5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 HMGCLL1Q8TB92 370 aa5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 TRPC4APQ8TEL6 797 aa5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 AP2M1Q96CW1 435 aa5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 CMTM5Q96DZ9 223 aa5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 COX14Q96I36 57 aa5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 CCT7Q99832 543 aa5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 P2RY13Q9BPV8 354 aa5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM79Q9BSE2 394 aa5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 FBRSQ9HAH7 460 aa5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 MID1IP1Q9NPA3 183 aa5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM45AQ9NWC5 275 aa5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 CLDND1Q9NY35 253 aa5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 CD274Q9NZQ7 290 aa5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 GULP1Q9UBP9 304 aa5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 CD84Q9UIB8 345 aa5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 ITM2BQ9Y287 266 aa5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 STK38LQ9Y2H1 464 aa5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 CKAP5Q14008 2032 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 A0A1W2PPC1 479 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 GOLGA8OA6NCC3 632 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 E9PBE3 544 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 NPIPB8E9PQR5 432 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 GOLGA8NF8WBI6 632 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 H0YHG0 523 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 OR7A17O14581 309 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 GYG2O15488 501 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 DCXO43602 365 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 TSPAN6O43657 245 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 KLHL41O60662 606 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 VPS4BO75351 444 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 EPHX1P07099 455 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 UROSP10746 265 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 THRAP10827 490 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 COX4I1P13073 169 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 ITGB6P18564 788 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 TSPAN8P19075 237 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 MSH3P20585 1137 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 C5AR1P21730 350 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 PIK3R1P27986 724 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 MAPK9P45984 424 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 SLC6A12P48065 614 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 ACADVLP49748 655 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 HNMTP50135 292 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 COPAP53621 1224 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 CTSCP53634 463 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 FOXA1P55317 472 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 SEC13P55735 322 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 AP1S2P56377 157 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 ERVPABLB-1P60509 514 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 CNTN1Q12860 1018 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 GRIK2Q13002 908 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 TRAF3Q13114 568 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 SQLEQ14534 574 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 ACOX1Q15067 660 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 CST6Q15828 149 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 POM121L1PQ3SYA9 428 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 DNAL1Q4LDG9 190 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM196Q5HYL7 178 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 WASHC2DQ5SRD0 308 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 FBXW10Q5XX13 1052 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 CLEC6AQ6EIG7 209 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 PGM2L1Q6PCE3 622 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 LONP2Q86WA8 852 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 VRK3Q8IV63 474 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 TCAIMQ8N3R3 496 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 AADATQ8N5Z0 425 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 FAM13CQ8NE31 585 aa5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 OR2T3Q8NH03 318 aa5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.8 ms