RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393389.7

ANKRD42-202, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 4,066 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-202ENST00000393389 PTNP21246 168 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 FDXRP22570 491 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ALDH3A2P51648 485 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ADGRF1Q5T601 910 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ALKAL1Q6UXT8 129 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC34A3Q8N130 599 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 AMER2Q8N7J2 671 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 MYLIPQ8WY64 445 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 TOP1MTQ969P6 601 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 TSPAN18Q96SJ8 248 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 GIMAP4Q9NUV9 329 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 OLAHQ9NV23 265 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 TMEM181Q9P2C4 612 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 SNPHO15079 494 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 PCDH8O95206 1070 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 CCDC159P0C7I6 412 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 TNFRSF1BP20333 461 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 SPAM1P38567 509 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 RPS7P62081 194 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 MYBPC3Q14896 1274 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 RTP2Q5QGT7 225 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 CASP12Q6UXS9 341 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ITIH5Q86UX2 942 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM9CQ8IZT9 166 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC15A4Q8N697 577 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 OR4K1Q8NGD4 311 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 GAB3Q8WWW8 586 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF599Q96NL3 588 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 COPS4Q9BT78 406 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 DNAJC11Q9NVH1 559 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ERVK-18Q9QC07 812 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 MTRRQ9UBK8 725 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 TNFRSF11BO00300 401 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 TRIM24O15164 1050 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 HTR7P34969 479 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 CYP2A13Q16696 494 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 CERS6Q6ZMG9 384 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 PGBD5Q8N414 524 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 TFAP2CQ92754 450 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 NT5C3BQ969T7 300 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 TMEM125Q96AQ2 219 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 MYRFLQ96LU7 910 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF597Q96LX8 424 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 GPR78Q96P69 363 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 KCTD5Q9NXV2 234 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 SPG21Q9NZD8 308 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 PCTPQ9UKL6 214 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 MAGEB17A8MXT2 336 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 H3BMQ9 156 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 TAF4O00268 1085 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 COCHO43405 550 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 SCELO95171 688 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 TGFB1P01137 390 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 HPCAL1P37235 193 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ACLYP53396 1101 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 CNTN1Q12860 1018 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ANKRD34AQ69YU3 496 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 HMBOX1Q6NT76 420 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 PTCHD4Q6ZW05 846 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 BBS7Q8IWZ6 715 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 MINDY1Q8N5J2 469 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 AADATQ8N5Z0 425 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 LEMD2Q8NC56 503 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 PROX1Q92786 737 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ZUFSPQ96AP4 578 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 DMRTB1Q96MA1 342 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 COG8Q96MW5 612 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 LHPPQ9H008 270 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 C11orf16Q9NQ32 467 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 BTBD3Q9Y2F9 522 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 KCNE2Q9Y6J6 123 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM220BPB1ANY3 271 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 RASAL1O95294 804 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 PREPP48147 710 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 C2orf80Q0P641 193 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 SEMA3BQ13214 749 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 C6orf141Q5SZD1 244 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 RAET1GQ6H3X3 334 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms