RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 DPP3Q9NY33 737 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPHK1Q9NYA1 384 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 STK26Q9P289 416 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 DAPK2Q9UIK4 370 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 MMP24Q9Y5R2 645 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRSS21Q9Y6M0 314 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD61A6NGH8 418 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 DFFBO76075 338 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZFAND5O76080 213 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPIP06744 558 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHV4-31P0DP07 118 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 MNDAP41218 407 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDH13P55290 713 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 HERV-K104P61576 105 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 LMOD3Q0VAK6 560 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 PHLDA2Q53GA4 152 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPATA1Q5VX52 437 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAAP20Q6NZ36 180 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF595Q8IYB9 648 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 MARVELD2Q8N4S9 558 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF614Q8N883 585 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 DBF4BQ8NFT6 615 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR11H4Q8NGC9 324 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 SYT15Q9BQS2 421 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 PITPNM3Q9BZ71 974 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAF1Q9H063 256 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 WNT5BQ9H1J7 359 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC68Q9H2F9 335 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDE7BQ9NP56 450 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 EQTNQ9NQ60 294 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 SERINC1Q9NRX5 453 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF186Q9NXI6 227 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAB2Q9NYJ8 693 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 B3GAT1Q9P2W7 334 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 EPHA6Q9UF33 1036 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 FEZF1A0PJY2 475 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 H7C423 109 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 DCXO43602 365 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 GFPT2O94808 682 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDH3P22223 829 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTPN3P26045 913 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACTN2P35609 894 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAZP56270 477 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBXN2AP68543 259 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRKG2Q13237 762 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNAPC1Q16533 368 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 UGP2Q16851 508 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 ODF4Q2M2E3 257 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 C20orf194Q5TEA3 1177 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 RTN4RL2Q86UN3 420 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 GTSCR1Q86UQ5 136 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNAAF5Q86Y56 855 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 LACC1Q8IV20 430 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIRREL3Q8IZU9 778 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR5AP2Q8NGF4 316 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR10S1Q8NGN2 331 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR52N5Q8NH56 324 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 SSMEM1Q8WWF3 244 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLAMF9Q96A28 289 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTERQ96BW5 349 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 DHX58Q96C10 678 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPDL1Q96EA4 605 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 MOCOSQ96EN8 888 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 SFXN2Q96NB2 322 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATOH8Q96SQ7 321 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAD9AQ99638 391 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 FUCA2Q9BTY2 467 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 MXD3Q9BW11 206 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLEC7AQ9BXN2 247 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIM15Q9C019 465 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 MIS12Q9H081 205 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 OPA3Q9H6K4 179 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 P4HTMQ9NXG6 502 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 GRID1Q9ULK0 1009 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR37Q9Y2I8 494 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNX8Q9Y5X2 465 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 CACNA1FO60840 1977 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 NOTCH3Q9UM47 2321 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM221A6NGB7 291 aa2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms