RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354376.3

C9orf163-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 163, humanhuman

Gene C9orf163, Length 2,572 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf163-201ENST00000354376 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 CENPKQ9BS16 269 aa22■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 GRIP2Q9C0E4 1043 aa22■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa22■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 COQ6Q9Y2Z9 468 aa22■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 CLIC3O95833 236 aa22■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 IMPDH2P12268 514 aa22■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 NHSL2Q5HYW2 709 aa22■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 TMEM240Q5SV17 173 aa22■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 PPP4R4Q6NUP7 873 aa22■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 PHACTR4Q8IZ21 702 aa22■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 C10orf111Q8N326 155 aa22■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 FAM86B1Q8N7N1 296 aa22■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa22■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 TRPV3Q8NET8 790 aa22■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 SELENOMQ8WWX9 145 aa22■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 DPY30Q9C005 99 aa22■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa22■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 CARNS1A5YM72 827 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 SLC28A1O00337 649 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 LRATO95237 230 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 FASP25445 335 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 HSPA13P48723 471 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 PWP1Q13610 501 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 SF1Q15637 639 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 ANKRD46Q86W74 232 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 EGLN2Q96KS0 407 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 RAD9AQ99638 391 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 TBCDQ9BTW9 1192 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 ARNTLO00327 626 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 NUAK1O60285 661 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 COQ9O75208 318 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 PCNAP12004 261 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 CCT8P50990 548 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 DHCR24Q15392 516 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 BRAT1Q6PJG6 821 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 CARM1Q86X55 608 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 AHI1Q8N157 1196 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 OR10A6Q8NH74 314 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 NCSTNQ92542 709 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 RNF145Q96MT1 663 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 ZNF583Q96ND8 569 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 TSSK3Q96PN8 268 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 VCX3AQ9NNX9 186 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 ATXN10Q9UBB4 475 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 TRANK1O15050 2925 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa21.98■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 A0A1W2PQ67 120 aa21.98■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 ACOX3O15254 700 aa21.98■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 HLA-EP13747 358 aa21.98■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 PFKLP17858 780 aa21.98■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 MSH3P20585 1137 aa21.98■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 APIPQ96GX9 242 aa21.98■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 C1orf109Q9NX04 203 aa21.98■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 IL36AQ9UHA7 158 aa21.98■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 C16orf96A6NNT2 1141 aa21.98■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 TSPAN6O43657 245 aa21.98■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 SH3BGRLO75368 114 aa21.98■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 GSNP06396 782 aa21.98■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 PGRP06401 933 aa21.98■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 HTR1EP28566 365 aa21.98■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 SLC6A12P48065 614 aa21.98■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 TBPL2Q6SJ96 375 aa21.98■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 NXPE3Q969Y0 559 aa21.98■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 OSBPL11Q9BXB4 747 aa21.98■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 HPS4Q9NQG7 708 aa21.98■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 SMOXQ9NWM0 555 aa21.98■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 ANAPC2Q9UJX6 822 aa21.98■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 UTS2RQ9UKP6 389 aa21.98■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 KANSL1LA0AUZ9 987 aa21.97■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 CLPTM1O96005 669 aa21.97■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 CYP17A1P05093 508 aa21.97■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 HIST1H2ADP20671 130 aa21.97■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 MAPKAPK3Q16644 382 aa21.97■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 ADNP2Q6IQ32 1131 aa21.97■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa21.97■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa21.97■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 HIST1H2AJQ99878 128 aa21.97■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 H2AFJQ9BTM1 129 aa21.97■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 GFYI3L273 518 aa21.97■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 KCNH1O95259 989 aa21.97■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 TNFAIP8O95379 198 aa21.97■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 NFKBIAP25963 317 aa21.97■■□□□ 1.11
C9orf163-201ENST00000354376 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.5 ms