RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344770.6

PDZK1-201, Transcript of PDZ domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PDZK1, Length 2,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1-201ENST00000344770 CHID1Q9BWS9 393 aa9.64□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa9.64□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 ANO3Q9BYT9 981 aa9.64□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 MMP27Q9H306 513 aa9.64□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 BCAS3Q9H6U6 928 aa9.64□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 RIMS3Q9UJD0 308 aa9.64□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 CDH9Q9ULB4 789 aa9.64□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa9.64□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa9.64□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 RAD54BQ9Y620 910 aa9.64□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 A0A1W2PRV1 198 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 CLDN25C9JDP6 229 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 SEC14L5O43304 696 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 VEGFDO43915 354 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 UGDHO60701 494 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 DKK1O94907 266 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 HTR3BO95264 441 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 CD63P08962 238 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 CD3GP09693 182 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 OR4E1P0C645 316 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 MCF2P10911 925 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 SELPP16109 830 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 CHRNB2P17787 502 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 ADRA1DP25100 572 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 HOXC8P31273 242 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 PPP3CCP48454 512 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 MAPK10P53779 464 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 TMBIM6P55061 237 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 GDF10P55107 478 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 VAMP2P63027 116 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 CD300CQ08708 224 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 ORC1Q13415 861 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 RAB30Q15771 203 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 TMEM119Q4V9L6 283 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 EFHC2Q5JST6 749 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 PPM1LQ5SGD2 360 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 ZNF618Q5T7W0 954 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 LRRC8DQ7L1W4 858 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 DEFB128Q7Z7B8 93 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 HPS6Q86YV9 775 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 C4orf33Q8N1A6 199 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 SLC15A4Q8N697 577 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 DAGLBQ8NCG7 672 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 ZBTB34Q8NCN2 500 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 FIBINQ8TAL6 211 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 NT5C3BQ969T7 300 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 ZNF597Q96LX8 424 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 BDH2Q9BUT1 245 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 TEX12Q9BXU0 123 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 PBX4Q9BYU1 374 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 OPA3Q9H6K4 179 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 NT5MQ9NPB1 228 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 ACTR10Q9NZ32 417 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 KLHL20Q9Y2M5 609 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 C17orf102A2RUQ5 167 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 TRIM38O00635 465 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 CYP26A1O43174 497 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 FAM155BO75949 473 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 IPO13O94829 963 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 ATE1O95260 518 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 TGM1P22735 817 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 SREBF1P36956 1147 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 PIK3CBP42338 1070 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 NDST2P52849 883 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 CAPZA1P52907 286 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 TPTEP56180 551 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 SP4Q02446 784 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 SEMA5AQ13591 1074 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 FLOT2Q14254 428 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 ANGPT1Q15389 498 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 TRIM61Q5EBN2 209 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 KRT80Q6KB66 452 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 C1orf94Q6P1W5 598 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 SERINC5Q86VE9 423 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 ZNF679Q8IYX0 411 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 BLIDQ8IZY5 108 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 NAGSQ8N159 534 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 OR8K5Q8NH50 307 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 PPP1R35Q8TAP8 253 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 CD101Q93033 1021 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 CMTM5Q96DZ9 223 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 C9orf72Q96LT7 481 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 NEU1Q99519 415 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PDZK1-201ENST00000344770 MXRA8Q9BRK3 442 aa9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms