RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 PAGE2BQ5JRK9 111 aa4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 LIPJQ5W064 366 aa4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 SULT1C3Q6IMI6 304 aa4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 SLC30A6Q6NXT4 461 aa4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 OTOAQ7RTW8 1153 aa4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 SZRD1Q7Z422 152 aa4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 CLNKQ7Z7G1 428 aa4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM126BQ8IUX1 230 aa4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 LIX1LQ8IVB5 337 aa4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 CPNE9Q8IYJ1 553 aa4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 POU5F2Q8N7G0 328 aa4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF516Q92618 1163 aa4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 WNT8BQ93098 351 aa4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 KLHL32Q96NJ5 620 aa4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 PANX3Q96QZ0 392 aa4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 PCDHB18PQ96TA0 734 aa4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 CGRRF1Q99675 332 aa4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 ADGRE3Q9BY15 652 aa4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 PITPNM3Q9BZ71 974 aa4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 NANOGQ9H9S0 305 aa4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 TAS2R3Q9NYW6 316 aa4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 PCDHGB4Q9UN71 923 aa4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 ALG6Q9Y672 507 aa4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 STYXL1Q9Y6J8 313 aa4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 ARID2Q68CP9 1835 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 LOC285556D6RIA3 1793 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 PTPRJQ12913 1337 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 C2CD2LO14523 706 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 DVL2O14641 736 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 OGTO15294 1046 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 MAGEB2O15479 319 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 MSCO60682 206 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 PRKD3O94806 890 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 BCL10O95999 233 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 CALCAP01258 141 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 LGALS2P05162 132 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 GSNP06396 782 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 HCKP08631 526 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 BMP1P13497 986 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 INSRRP14616 1297 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 CD58P19256 250 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 GNA15P30679 374 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 THBS2P35442 1172 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 PGM1P36871 562 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 TNFSF9P41273 254 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 ADCYAP1R1P41586 468 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 PIK3CGP48736 1102 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 NDST2P52849 883 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 KCNA10Q16322 511 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 ACER2Q5QJU3 275 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 MFSD5Q6N075 450 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 VN1R5Q7Z5H4 357 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 NOXA1Q86UR1 476 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 OR8H3Q8N146 312 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM35BQ8NCS4 154 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 AGBL5Q8NDL9 886 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 OR2L5Q8NG80 312 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 OR5B17Q8NGF7 314 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 OR6X1Q8NH79 312 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 ZFAND1Q8TCF1 268 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 BRI3BPQ8WY22 251 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM41AQ96HV5 264 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 GCNAQ96QF7 691 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 MED18Q9BUE0 208 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 TXLNGYQ9BZA5 131 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 RNPEPQ9H4A4 650 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 ABCC13Q9NSE7 274 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 TAS2R10Q9NYW0 307 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF224Q9NZL3 707 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 SH3BP4Q9P0V3 963 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 EPHA6Q9UF33 1036 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 SARDHQ9UL12 918 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 PHTF1Q9UMS5 762 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 NDUFAF1Q9Y375 327 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 FKBP7Q9Y680 259 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 XKRY2A2RUG3 117 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 GSAPA4D1B5 854 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 RRN3P2A6NIE6 340 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 ITGB1BP1O14713 200 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 ARHGEF9O43307 516 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 RAD51CO43502 376 aa4.86□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 NOBOXO60393 691 aa4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms