RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321358.11

YBX1-201, Transcript of Y-box binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene YBX1, Length 1,514 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1-201ENST00000321358 CKMT2P17540 419 aa20.56■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 LIMK1P53667 647 aa20.56■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 PHKG1Q16816 387 aa20.56■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 PROX2Q3B8N5 592 aa20.56■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 KLHL35Q6PF15 583 aa20.56■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 RASGRP3Q8IV61 690 aa20.56■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 KIAA2013Q8IYS2 634 aa20.56■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 CCDC63Q8NA47 563 aa20.56■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 OR52E1Q8NGJ3 308 aa20.56■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 DLG3Q92796 817 aa20.56■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 EXT2Q93063 718 aa20.56■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 TLCD1Q96CP7 247 aa20.56■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 CD274Q9NZQ7 290 aa20.56■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 TMEM216Q9P0N5 145 aa20.56■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 IKZF3Q9UKT9 509 aa20.56■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 RNF215Q9Y6U7 377 aa20.56■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa20.56■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa20.55■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 SUPT3HB4E1H0 165 aa20.55■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 MYO1CO00159 1063 aa20.55■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 SUPT3HO75486 399 aa20.55■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 TPBGLP0DKB5 382 aa20.55■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 PNLIPP16233 465 aa20.55■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 TAC1P20366 129 aa20.55■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 ALDH4A1P30038 563 aa20.55■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 SHMT2P34897 504 aa20.55■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 GPR3P46089 330 aa20.55■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 CDKL1Q00532 357 aa20.55■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 TGFBIQ15582 683 aa20.55■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 PPP1R3AQ16821 1122 aa20.55■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 TECRLQ5HYJ1 363 aa20.55■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 SRMSQ9H3Y6 488 aa20.55■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 KCNK4Q9NYG8 393 aa20.55■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 XPR1Q9UBH6 696 aa20.55■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 MID2Q9UJV3 735 aa20.55■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 TMEM131Q92545 1883 aa20.55■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 SMIM24O75264 130 aa20.54■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 HNMTP50135 292 aa20.54■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 RAB28P51157 221 aa20.54■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 ARHGAP19Q14CB8 494 aa20.54■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 CDKL4Q5MAI5 379 aa20.54■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 C16orf46Q6P387 395 aa20.54■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 AMIGO1Q86WK6 493 aa20.54■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 OR4E2Q8NGC2 313 aa20.54■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 NETO1Q8TDF5 533 aa20.54■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 PKP4Q99569 1192 aa20.54■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 SLC32A1Q9H598 525 aa20.54■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 MED4Q9NPJ6 270 aa20.54■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 SPATA7Q9P0W8 599 aa20.54■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 CIDEBQ9UHD4 219 aa20.54■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 TMCO1Q9UM00 188 aa20.54■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 PLLPQ9Y342 182 aa20.54■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 LILRA5A6NI73 299 aa20.53■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 MYF5P13349 255 aa20.53■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 GFAPP14136 432 aa20.53■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 CREB1P16220 341 aa20.53■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 AMD1P17707 334 aa20.53■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 EPHA4P54764 986 aa20.53■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 CCSMST1Q4G0I0 132 aa20.53■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 ANKS6Q68DC2 871 aa20.53■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa20.53■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 SYTL1Q8IYJ3 562 aa20.53■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 TCAIMQ8N3R3 496 aa20.53■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 TCP10LQ8TDR4 215 aa20.53■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 ATOH8Q96SQ7 321 aa20.53■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 NUDT4Q9NZJ9 180 aa20.53■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 OR6C2Q9NZP2 312 aa20.53■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 PLAGL1Q9UM63 463 aa20.53■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 FAM221BA6H8Z2 402 aa20.53■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 TYROBPO43914 113 aa20.53■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 SLC16A8O95907 504 aa20.53■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 KCNC1P48547 511 aa20.53■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 SULT1C3Q6IMI6 304 aa20.53■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 ARMC6Q6NXE6 501 aa20.53■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 GUSBP11Q6P575 273 aa20.53■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 OR10G6Q8NH81 332 aa20.53■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 CCDC74AQ96AQ1 378 aa20.53■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 EPB41L1Q9H4G0 881 aa20.53■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
YBX1-201ENST00000321358 UBXN8O00124 270 aa20.52■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 TK2O00142 265 aa20.52■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 TM9SF1O15321 606 aa20.52■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 TNFSF14O43557 240 aa20.52■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 PLIN3O60664 434 aa20.52■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 UBXN7O94888 489 aa20.52■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 ZWINTO95229 277 aa20.52■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 PNLIPRP1P54315 467 aa20.52■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 PRKAA1Q13131 559 aa20.52■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 TTMPQ5BVD1 217 aa20.52■□□□□ 0.87
YBX1-201ENST00000321358 ZNF438Q7Z4V0 828 aa20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms