RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319511.6

TMUB2-201, Transcript of transmembrane and ubiquitin like domain containing 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMUB2, Length 2,418 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2-201ENST00000319511 GRK1Q15835 563 aa12.96□□□□□ -0.33
TMUB2-201ENST00000319511 HADHQ16836 314 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
TMUB2-201ENST00000319511 TPGS2Q68CL5 300 aa12.96□□□□□ -0.33
TMUB2-201ENST00000319511 TEX261Q6UWH6 196 aa12.96□□□□□ -0.33
TMUB2-201ENST00000319511 USP45Q70EL2 814 aa12.96□□□□□ -0.33
TMUB2-201ENST00000319511 NRARPQ7Z6K4 114 aa12.96□□□□□ -0.33
TMUB2-201ENST00000319511 YIPF7Q8N8F6 280 aa12.96□□□□□ -0.33
TMUB2-201ENST00000319511 NEDD4LQ96PU5 975 aa12.96□□□□□ -0.33
TMUB2-201ENST00000319511 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP12.96□□□□□ -0.33
TMUB2-201ENST00000319511 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
TMUB2-201ENST00000319511 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
TMUB2-201ENST00000319511 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa12.96□□□□□ -0.33
TMUB2-201ENST00000319511 EXD2Q9NVH0 621 aa12.96□□□□□ -0.33
TMUB2-201ENST00000319511 DNPEPQ9ULA0 475 aa12.96□□□□□ -0.33
TMUB2-201ENST00000319511 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa12.96□□□□□ -0.33
TMUB2-201ENST00000319511 U3KQ87 197 aa12.96□□□□□ -0.33
TMUB2-201ENST00000319511 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 FPGTO14772 594 aa12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 ANGPT2O15123 496 aa12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 TREHO43280 583 aa12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 C1QBP02746 253 aa12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 IL1R2P27930 398 aa12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 DPP6P42658 865 aa12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 PGDP52209 483 aa12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 LSM3P62310 102 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 SLC3A1Q07837 685 aa12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 TRAM2Q15035 370 aa12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 PKDCCQ504Y2 493 aa12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 HSD17B12Q53GQ0 312 aa12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 C3orf33Q6P1S2 294 aa12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 BHLHB9Q6PI77 547 aa12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 CLEC2AQ6UVW9 174 aa12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 KDELC1Q6UW63 502 aa12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 ZMIZ2Q8NF64 920 aa12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 OR5T2Q8NGG2 359 aa12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 MCFD2Q8NI22 146 aa12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 SLC35B2Q8TB61 432 aa12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 BBS4Q96RK4 519 aa12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 OSMRQ99650 979 aa12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 BCL7BQ9BQE9 202 aa12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 ANKHQ9HCJ1 492 aa12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 CRTAC1Q9NQ79 661 aa12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 BABAM2Q9NXR7 383 aa12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 BFARQ9NZS9 450 aa12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 TRHDEQ9UKU6 1024 aa12.96□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 TMEM82A0PJX8 343 aa12.95□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 RGSL1A5PLK6 1076 aa12.95□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 CFLARO15519 480 aa12.95□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 SNNO75324 88 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 PLATP00750 562 aa12.95□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 PRF1P14222 555 aa12.95□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 HOXC8P31273 242 aa12.95□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 CAPGP40121 348 aa12.95□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 TAB1Q15750 504 aa12.95□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 SSX2Q16385 188 aa12.95□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 TMEM44Q2T9K0 475 aa12.95□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 DEFB115Q30KQ5 88 aa12.95□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 XKR4Q5GH76 650 aa12.95□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 MROH9Q5TGP6 573 aa12.95□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 C17orf99Q6UX52 265 aa12.95□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 SLC16A13Q7RTY0 426 aa12.95□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 GALNT10Q86SR1 603 aa12.95□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 OR8H2Q8N162 312 aa12.95□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 LIX1Q8N485 282 aa12.95□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 KYQ8NBH2 561 aa12.95□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa12.95□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 SLCO4A1Q96BD0 722 aa12.95□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 PAFAH2Q99487 392 aa12.95□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 FAM118BQ9BPY3 351 aa12.95□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 NIT2Q9NQR4 276 aa12.95□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 ABCD2Q9UBJ2 740 aa12.95□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 MIOXQ9UGB7 285 aa12.95□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 TSPAN16Q9UKR8 245 aa12.95□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 SNX6Q9UNH7 406 aa12.95□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 USP22Q9UPT9 525 aa12.95□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 MGAT4BQ9UQ53 548 aa12.95□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 PPEF2O14830 753 aa12.94□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 DCXO43602 365 aa12.94□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 PIAS1O75925 651 aa12.94□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 ITGAVP06756 1048 aa12.94□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 ZNF806P0C7X5 589 aa12.94□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 SMIM6P0DI80 62 aa12.94□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 KDELR1P24390 212 aa12.94□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 ACTR1BP42025 376 aa12.94□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 RPS5P46782 204 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 KCNK10P57789 538 aa12.94□□□□□ -0.34
TMUB2-201ENST00000319511 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms