RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318978.5

CTXN1-201, Transcript of cortexin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN1, Length 1,274 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1-201ENST00000318978 PWWP2AQ96N64 755 aa24.64■■□□□ 1.54
CTXN1-201ENST00000318978 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa24.64■■□□□ 1.54
CTXN1-201ENST00000318978 EFHD1Q9BUP0 239 aa24.64■■□□□ 1.54
CTXN1-201ENST00000318978 PITPNM3Q9BZ71 974 aa24.64■■□□□ 1.54
CTXN1-201ENST00000318978 FBXO5Q9UKT4 447 aa24.64■■□□□ 1.54
CTXN1-201ENST00000318978 NFS1Q9Y697 457 aa24.64■■□□□ 1.54
CTXN1-201ENST00000318978 TIAF1O95411 115 aa24.63■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 ERVK-10P10266 1014 aa24.63■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 PKLRP30613 574 aa24.63■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 BDKRB1P46663 353 aa24.63■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 ARL4CP56559 192 aa24.63■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 MPP1Q00013 466 aa24.63■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 KIR2DS3Q14952 304 aa24.63■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 HIF1AQ16665 826 aa24.63■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 KYNUQ16719 465 aa24.63■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 RAB42Q8N4Z0 105 aa24.63■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 OR8K5Q8NH50 307 aa24.63■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 CFAP36Q96G28 342 aa24.63■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 FCRL4Q96PJ5 515 aa24.63■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 OR2A14Q96R47 310 aa24.63■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 GALPQ9UBC7 116 aa24.63■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 ERVH48-1M5A8F1 160 aa24.62■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 SCRG1O75711 98 aa24.62■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 MT-ND3P03897 115 aa24.62■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 NTRK1P04629 796 aa24.62■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 ELK3P41970 407 aa24.62■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 STAT5AP42229 794 aa24.62■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 C2orf54Q08AI8 447 aa24.62■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 TTLL9Q3SXZ7 439 aa24.62■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 TAX1BP1Q86VP1 789 aa24.62■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 SPATA4Q8NEY3 305 aa24.62■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 MAGEC3Q8TD91 643 aa24.62■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 RAD51AP1Q96B01 352 aa24.62■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 IL17FQ96PD4 163 aa24.62■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 CHMP2BQ9UQN3 213 aa24.62■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 SNX24Q9Y343 169 aa24.62■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 TMEM150CB9EJG8 249 aa24.61■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 HAUS5O94927 633 aa24.61■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 C1orf105O95561 183 aa24.61■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 CD9P21926 228 aa24.61■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 ATP5DP30049 168 aa24.61■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 CYP4F2P78329 520 aa24.61■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 ACSBG2Q5FVE4 666 aa24.61■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 MAATS1Q7Z4T9 603 aa24.61■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 IGDCC3Q8IVU1 814 aa24.61■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa24.61■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 PADI1Q9ULC6 663 aa24.61■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 MGAQ8IWI9 3026 aa24.61■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 IGSF10Q6WRI0 2623 aa24.6■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 A0A0J9YY10 115 aa24.6■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 NDC80O14777 642 aa24.6■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 RASGRF2O14827 1237 aa24.6■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 DLSTP36957 453 aa24.6■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 CCNFP41002 786 aa24.6■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 RPL21P46778 160 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 KLHL38Q2WGJ6 581 aa24.6■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF549Q6P9A3 640 aa24.6■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa24.6■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 BBOF1Q8ND07 529 aa24.6■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 SLC22A18Q96BI1 424 aa24.6■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 CERS2Q96G23 380 aa24.6■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa24.6■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 SYTL2Q9HCH5 934 aa24.6■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 LATS2Q9NRM7 1088 aa24.6■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 SERTAD3Q9UJW9 196 aa24.6■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 COMMD10Q9Y6G5 202 aa24.6■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 FAM187AA6NFU0 413 aa24.59■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 CYP2A7P20853 494 aa24.59■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 CARSP49589 748 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 CLCN7P51798 805 aa24.59■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 CUL1Q13616 776 aa24.59■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 GRB7Q14451 532 aa24.59■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 SLC5A12Q1EHB4 618 aa24.59■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 ANKMY2Q8IV38 441 aa24.59■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 LINC01555Q8NAE3 123 aa24.59■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 OR2L8Q8NGY9 312 aa24.59■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 SLC39A7Q92504 469 aa24.59■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 KCNJ9Q92806 393 aa24.59■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 LRRC39Q96DD0 335 aa24.59■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 TCTN2Q96GX1 697 aa24.59■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 DPH5Q9H2P9 285 aa24.59■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 CROTQ9UKG9 612 aa24.59■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 LOC400499M0QZD8 3231 aa24.58■■□□□ 1.53
CTXN1-201ENST00000318978 VPS26AO75436 327 aa24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms