RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 MVKQ03426 396 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF33AQ06730 810 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP20.73■□□□□ 0.918e-7■■■■□ 24.4
CCSAP-201ENST00000284617 FRMD7Q6ZUT3 714 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 TSPAN9O75954 239 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 IL7RP16871 459 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 PRKCHP24723 683 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 SLC35F5Q8WV83 523 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 LMLNQ96KR4 655 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D17Q9HA65 648 aa20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 LGR5O75473 907 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 ACADLP28330 430 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 CBX5P45973 191 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 PPM1HQ9ULR3 514 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 VARSP26640 1264 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 EPGNQ6UW88 154 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 CFHP08603 1231 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 RORCP51449 518 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 NRLP54845 237 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 TIGD6Q17RP2 521 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 ADGRF1Q5T601 910 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 TTLQ8NG68 377 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 TAMM41Q96BW9 452 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 CEP295NLQ96MC4 621 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 SLC29A3Q9BZD2 475 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 FLRT1Q9NZU1 646 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 DKK3Q9UBP4 350 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 CD36P16671 472 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 TPGS2Q68CL5 300 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 ASB3Q9Y575 518 aa20.72■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF541Q9H0D2 1346 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 PRAMEF12O95522 483 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 AHSGP02765 367 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 RYKP34925 604 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 WASP42768 502 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 DNASE1L1P49184 302 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 RAB2AP61019 212 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 SCARB2Q14108 478 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 CARD16Q5EG05 197 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 SIRPB2Q5JXA9 342 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 FBXL22Q6P050 247 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 RELL1Q8IUW5 271 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 SLC32A1Q9H598 525 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 ACTR3BQ9P1U1 418 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 DUXAA6NLW8 204 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 CLIC1O00299 241 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 PTPN18Q99952 460 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA7Q9P0W8 599 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 HAS3O00219 553 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 RASGRP1O95267 797 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 AKT2P31751 481 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 PLA2G16P53816 162 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 RPS24P62847 133 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 CARTPTQ16568 116 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 C1QTNF8P60827 252 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 ERVK-21P61565 698 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 VBP1P61758 197 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 RHDQ02161 417 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 TCEAL1Q15170 157 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 SWI5Q1ZZU3 235 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 NADK2Q4G0N4 442 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 POMZP3Q6PJE2 187 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 CITED4Q96RK1 184 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 COMMD4Q9H0A8 199 aa20.71■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 SPATS1Q496A3 300 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 SLC30A6Q6NXT4 461 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 COX18Q8N8Q8 333 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 OR10H4Q8NGA5 316 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 GRPEL2Q8TAA5 225 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 CRELD1Q96HD1 420 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 KCNS3Q9BQ31 491 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 SUV39H2Q9H5I1 410 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 SNTG1Q9NSN8 517 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 GLTPD2A6NH11 291 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 ALPPP05187 535 aa20.7■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 DSC3Q14574 896 aa20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms