RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270645.7

RCN3-201, Transcript of reticulocalbin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RCN3, Length 1,859 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3-201ENST00000270645 DNTTP04053 509 aa20.07■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 ITPKAP23677 461 aa20.07■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 TEAD1P28347 426 aa20.07■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 DPP6P42658 865 aa20.07■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 NR6A1Q15406 480 aa20.07■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 HM13Q8TCT9 377 aa20.07■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 PPP3R2Q96LZ3 170 aa20.07■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 SERPINI1Q99574 410 aa20.07■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa20.07■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 SLC52A3Q9NQ40 469 aa20.07■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa20.07■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 BBIP1A8MTZ0 92 aa20.06■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 NR5A2O00482 541 aa20.06■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 MRASO14807 208 aa20.06■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 CFLARO15519 480 aa20.06■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 RGS14O43566 566 aa20.06■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 KRT36O76013 467 aa20.06■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 PSMG1O95456 288 aa20.06■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 RPS21P63220 83 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 AP5B1Q2VPB7 878 aa20.06■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa20.06■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 AGTRAPQ6RW13 159 aa20.06■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 HACD2Q6Y1H2 254 aa20.06■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 TSPEARQ8WU66 669 aa20.06■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 C1orf50Q9BV19 199 aa20.06■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 DPEP2Q9H4A9 486 aa20.06■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 POMPQ9Y244 141 aa20.06■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa20.06■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 PRAMEF4O60810 478 aa20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 TRIM23P36406 574 aa20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 NFE2L1Q14494 772 aa20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 INPP5AQ14642 412 aa20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 IRF4Q15306 451 aa20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 PIGGQ5H8A4 983 aa20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 IER5LQ5T953 404 aa20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 DOK6Q6PKX4 331 aa20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 OR14C36Q8NHC7 312 aa20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 DNASE1L2Q92874 299 aa20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 STMN2Q93045 179 aa20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 TEX37Q96LM6 180 aa20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 TMEM45AQ9NWC5 275 aa20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 NDUFAF1Q9Y375 327 aa20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 PRKAB1Q9Y478 270 aa20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 XIRP2A4UGR9 3374 aa20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 H0Y3Z8 333 aa20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 KRT6AP02538 564 aa20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 KRT6BP04259 564 aa20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 CAPN3P20807 821 aa20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 ACADLP28330 430 aa20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 IMPA1P29218 277 aa20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 KRT6CP48668 564 aa20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 PSME3P61289 254 aa20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 ZNF423Q2M1K9 1284 aa20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 SMU1Q2TAY7 513 aa20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 TMEM259Q4ZIN3 620 aa20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 SGO1Q5FBB7 561 aa20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 RETREG3Q86VR2 466 aa20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 KLK6Q92876 244 aa20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 ZIM2Q9NZV7 527 aa20.05■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 SLC22A3O75751 556 aa20.04■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 SLC16A8O95907 504 aa20.04■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 C7P10643 843 aa20.04■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 UFM1P61960 85 aa20.04■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 SGCGQ13326 291 aa20.04■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 NAE1Q13564 534 aa20.04■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa20.04■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 VPS26BQ4G0F5 336 aa20.04■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa20.04■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 OR56A3Q8NH54 315 aa20.04■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 MAP10Q9P2G4 905 aa20.04■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 STOML1Q9UBI4 398 aa20.04■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 SLC23A2Q9UGH3 650 aa20.04■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 PACSIN3Q9UKS6 424 aa20.04■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 SCML1Q9UN30 329 aa20.04■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 SNX6Q9UNH7 406 aa20.04■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 A0A1W2PQU0 124 aa20.03■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 C9JVG2 144 aa20.03■□□□□ 0.8
RCN3-201ENST00000270645 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms