RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 LAPTM4AQ15012 233 aa14.6□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 SMU1Q2TAY7 513 aa14.6□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 CARD16Q5EG05 197 aa14.6□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 CACHD1Q5VU97 1274 aa14.6□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 P2RY8Q86VZ1 359 aa14.6□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 RHNO1Q9BSD3 238 aa14.6□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa14.6□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 SACM1LQ9NTJ5 587 aa14.6□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 C1orf109Q9NX04 203 aa14.6□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 KLQ9UEF7 1012 aa14.6□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 AP3M1Q9Y2T2 418 aa14.6□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 PKP3Q9Y446 797 aa14.6□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 SEC22BO75396 215 aa14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 CYP4B1P13584 511 aa14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 RPS24P62847 133 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 GBX1Q14549 363 aa14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 SGO1Q5FBB7 561 aa14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 ADCK1Q86TW2 530 aa14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 RGL4Q8IZJ4 473 aa14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 SETD9Q8NE22 299 aa14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 TNKS2Q9H2K2 1166 aa14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 RIBC2Q9H4K1 309 aa14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 LRTM1Q9HBL6 345 aa14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 TPRKBQ9Y3C4 175 aa14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 KDM1AO60341 852 aa14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 TLR5O60602 858 aa14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 ITGB6P18564 788 aa14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 MAGEA2P43356 314 aa14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 SERPINB10P48595 397 aa14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 NCS1P62166 190 aa14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 DGCR6Q14129 220 aa14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 CLCA4Q14CN2 919 aa14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 PGS1Q32NB8 556 aa14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 CCDC81Q6ZN84 652 aa14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 CEP68Q76N32 757 aa14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 TRIM46Q7Z4K8 759 aa14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 DSG4Q86SJ6 1040 aa14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 STK40Q8N2I9 435 aa14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 HPS1Q92902 700 aa14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 ADGRE3Q9BY15 652 aa14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 SERHLQ9NQF3 203 aa14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 NOD1Q9Y239 953 aa14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 TTC36A6NLP5 189 aa14.58□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 ACSL4O60488 711 aa14.58□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 ULK1O75385 1050 aa14.58□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 MT-ND2P03891 347 aa14.58□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 AKR1A1P14550 325 aa14.58□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 OR1G1P47890 313 aa14.58□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 DAPP51397 102 aa14.58□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 CDH4P55283 916 aa14.58□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 LRIF1Q5T3J3 769 aa14.58□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 RNF165Q6ZSG1 346 aa14.58□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa14.58□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 EID2BQ96D98 161 aa14.58□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 CIPCQ9C0C6 399 aa14.58□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 CRISPLD1Q9H336 500 aa14.58□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 ASIC5Q9NY37 505 aa14.58□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 OARD1Q9Y530 152 aa14.58□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa14.58□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
SYP-201ENST00000263233 TTC34A8MYJ7 566 aa14.58□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 INPPL1O15357 1258 aa14.58□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 ERN1O75460 977 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 PRAMEF12O95522 483 aa14.58□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 GSNP06396 782 aa14.58□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 PSMB9P28065 219 aa14.58□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 ARPP19P56211 112 aa14.58□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 CXCR4P61073 352 aa14.58□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 IL1RL1Q01638 556 aa14.58□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 CACNG1Q06432 222 aa14.58□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 DSC1Q08554 894 aa14.58□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 KEAP1Q14145 624 aa14.58□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 PHKG1Q16816 387 aa14.58□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 CTXN3Q4LDR2 81 aa14.58□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 TMEM53Q6P2H8 277 aa14.58□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 EGFL8Q99944 293 aa14.58□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 INPP5KQ9BT40 448 aa14.58□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 APOL5Q9BWW9 433 aa14.58□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 CD244Q9BZW8 370 aa14.58□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 KCNH6Q9H252 994 aa14.58□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 OPTCQ9UBM4 332 aa14.58□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 ABCG2Q9UNQ0 655 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms