RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 HPS4Q9NQG7 708 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 TMED5Q9Y3A6 229 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 TSPAN6O43657 245 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 CATP04040 527 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 FCARP24071 287 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 MED21Q13503 144 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 POM121L1PQ3SYA9 428 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 LIPJQ5W064 366 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 NEK5Q6P3R8 708 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 SLC22A15Q8IZD6 547 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 TDHQ8IZJ6 230 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 Q9H521 79 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 SCOCQ9UIL1 159 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 SEC22BO75396 215 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 IL6P05231 212 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 ADRB3P13945 408 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 CTSCP53634 463 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 FCHO2Q0JRZ9 810 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 MESP2Q0VG99 397 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 NANOGP8Q6NSW7 305 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 KIAA2013Q8IYS2 634 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 DNAJB8Q8NHS0 232 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 SELENOMQ8WWX9 145 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 RAB7BQ96AH8 199 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 SLCO4A1Q96BD0 722 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 NUS1Q96E22 293 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 FAM129BQ96TA1 746 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 ELOVL6Q9H5J4 265 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 NANOGQ9H9S0 305 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 DYRK4Q9NR20 520 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 RAB26Q9ULW5 256 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 ITM2BQ9Y287 266 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 SNX13Q9Y5W8 968 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 KANSL1LA0AUZ9 987 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 PRPS2P11908 318 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 ATP6V1B2P21281 511 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 MAPK1P28482 360 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 HTR1EP28566 365 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 GSK3BP49841 420 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 PWP1Q13610 501 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 DLEU7Q6UYE1 221 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 CYP2R1Q6VVX0 501 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 DNAJB14Q8TBM8 379 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 FOPNLQ96NB1 174 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 ACPTQ9BZG2 426 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 DPY30Q9C005 99 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 ZFP14Q9HCL3 533 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 C2orf16Q68DN1 1984 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 A6NHS1 94 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 ARHGEF33A8MVX0 844 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 DENRO43583 198 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 SOD1P00441 154 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 PDYNP01213 254 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 GPIP06744 558 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 HLA-EP13747 358 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 JUPP14923 745 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 GRIA3P42263 894 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 PFN3P60673 137 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 HMGCS1Q01581 520 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 LIPEQ05469 1076 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM220Q6QAJ8 160 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 OR8J3Q8NGG0 315 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 CMTM7Q96FZ5 175 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 HDAC8Q9BY41 377 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 CLMPQ9H6B4 373 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 SLC22A14Q9Y267 594 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 AP3M1Q9Y2T2 418 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 PROSER1Q86XN7 944 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 SLC13A3Q8WWT9 602 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 SUSD6Q92537 303 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 SLC45A3Q96JT2 553 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXD9-201ENST00000249499 CHD9Q3L8U1 2897 aa22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms