RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243103.3

HOXC12-201, Transcript of homeobox C12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC12, Length 3,335 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12-201ENST00000243103 CPA6Q8N4T0 437 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC12-201ENST00000243103 CCM2Q9BSQ5 444 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC12-201ENST00000243103 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXC12-201ENST00000243103 ACOT13Q9NPJ3 140 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC12-201ENST00000243103 ERAP1Q9NZ08 941 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC12-201ENST00000243103 SLC23A1Q9UHI7 598 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC12-201ENST00000243103 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXC12-201ENST00000243103 GJB3O75712 270 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC12-201ENST00000243103 HRGP04196 525 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC12-201ENST00000243103 NTRK1P04629 796 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC12-201ENST00000243103 TSPAN19P0C672 248 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC12-201ENST00000243103 RAP2AP10114 183 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC12-201ENST00000243103 ITGALP20701 1170 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC12-201ENST00000243103 KRT20P35900 424 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC12-201ENST00000243103 TTLL4Q14679 1199 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC12-201ENST00000243103 TSTQ16762 297 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXC12-201ENST00000243103 DDR2Q16832 855 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC12-201ENST00000243103 DGKKQ5KSL6 1271 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC12-201ENST00000243103 NADSYN1Q6IA69 706 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC12-201ENST00000243103 CEP68Q76N32 757 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC12-201ENST00000243103 BEND5Q7L4P6 421 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC12-201ENST00000243103 ROPN1LQ96C74 230 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC12-201ENST00000243103 DIRAS2Q96HU8 199 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC12-201ENST00000243103 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXC12-201ENST00000243103 CYP3A43Q9HB55 503 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC12-201ENST00000243103 RNF112Q9ULX5 631 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC12-201ENST00000243103 GSAPA4D1B5 854 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 YJEFN3A6XGL0 299 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 RFXAPO00287 272 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 LRRTM2O43300 516 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 G6PDP11413 515 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 NR2C2P49116 596 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 PTPN5P54829 565 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 SNX16P57768 344 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 HMGCS1Q01581 520 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 ZPBP2Q6X784 338 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 TMEM40Q8WWA1 233 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 USP7Q93009 1102 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 PTERQ96BW5 349 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 IKZF5Q9H5V7 419 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 MEAF6Q9HAF1 191 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 PIGVQ9NUD9 493 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 RBPJLQ9UBG7 517 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 PGAP2Q9UHJ9 254 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 SNX7Q9UNH6 387 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 PKP3Q9Y446 797 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 BNIP3LO60238 219 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 PDE9AO76083 593 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 AP2A2O94973 939 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 C1QCP02747 245 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 SYPP08247 313 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 SOX6P35712 828 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 SOX9P48436 509 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 CDKN2DP55273 166 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 FCGRTP55899 365 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 RPL38P63173 70 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 UNC50Q53HI1 259 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 LBX2Q6XYB7 198 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 SCAMP5Q8TAC9 235 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 SMIM14Q96QK8 99 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 KRT84Q9NSB2 600 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 MCUBQ9NWR8 336 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 VAPAQ9P0L0 249 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 SCN1AP35498 2009 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 TNFSF8P32971 234 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 DCTP40126 519 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 HNF4AP41235 474 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 GPAT3Q53EU6 434 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 HECTD2Q5U5R9 776 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 PM20D1Q6GTS8 502 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 ASB18Q6ZVZ8 466 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 USP51Q70EK9 711 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 CYS1Q717R9 158 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 TMEM135Q86UB9 458 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 MIB1Q86YT6 1006 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 EXOC2Q96KP1 924 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 GSTO2Q9H4Y5 243 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 RAD18Q9NS91 495 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 COMMD3Q9UBI1 195 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 RGS13O14921 159 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 TPPPO94811 219 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 STARD3Q14849 445 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 PLET1Q6UQ28 207 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 UBQLNLQ8IYU4 475 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 BEST2Q8NFU1 509 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXC12-201ENST00000243103 SLC30A2Q9BRI3 323 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms