RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218652.11

NDFIP2-201, Transcript of Nedd4 family interacting protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NDFIP2, Length 4,625 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP2-201ENST00000218652 MED31Q9Y3C7 131 aa14.7□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 CARNS1A5YM72 827 aa14.7□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 LRRC72A6NJI9 287 aa14.7□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 VLDLRP98155 873 aa14.7□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 ADNP2Q6IQ32 1131 aa14.7□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 HID1Q8IV36 788 aa14.7□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 PHTF2Q8N3S3 785 aa14.7□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 TMEM199Q8N511 208 aa14.7□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 OR5T3Q8NGG3 340 aa14.7□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 C1orf216Q8TAB5 229 aa14.7□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 LRRC58Q96CX6 371 aa14.7□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 OXSMQ9NWU1 459 aa14.7□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 ZNF510Q9Y2H8 683 aa14.7□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 OR1I1O60431 355 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 RASGRP1O95267 797 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 TBX18O95935 607 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 KCNA5P22460 613 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 GJA8P48165 433 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 C1QTNF8P60827 252 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 SLC8B1Q6J4K2 584 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 ARMC10Q8N2F6 343 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 ASB9Q96DX5 294 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 KXD1Q9BQD3 176 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 TBC1D14Q9P2M4 693 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 CFL2Q9Y281 166 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 A0A1W2PRB8 838 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 CLIC1O00299 241 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 GNRH1P01148 92 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 ELNP15502 786 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 GALNT13Q8IUC8 556 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 GJD3Q8N144 294 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 LNX2Q8N448 690 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 TSPAN18Q96SJ8 248 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 HIPK3Q9H422 1215 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 SEPT4O43236 478 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 PRNPP04156 253 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 AVPR1BP47901 424 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 ANO7Q6IWH7 933 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 FCGR1BQ92637 280 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 CRELD1Q96HD1 420 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 FAM129BQ96TA1 746 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 CGREF1Q99674 301 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 YIPF4Q9BSR8 244 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 FZD10Q9ULW2 581 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 ARPC2O15144 300 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 ACOX3O15254 700 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 TLL1O43897 1013 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 DIRAS1O95057 198 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 OGNP20774 298 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 HTR7P34969 479 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 PPP3R1P63098 170 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 TLR1Q15399 786 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 LGI4Q8N135 537 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 OR2L3Q8NG85 312 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 FETUBQ9UGM5 382 aa14.69□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 USP32Q8NFA0 1604 aa14.68□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 PI15O43692 258 aa14.68□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 PCCBP05166 539 aa14.68□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 IMPDH1P20839 514 aa14.68□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 DPYSL2Q16555 572 aa14.68□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 FUT10Q6P4F1 479 aa14.68□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 KLHDC10Q6PID8 442 aa14.68□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 STON2Q8WXE9 905 aa14.68□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 TMBIM1Q969X1 311 aa14.68□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 HSPBAP1Q96EW2 488 aa14.68□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 SLC35G5Q96KT7 338 aa14.68□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 DEFB118Q96PH6 123 aa14.68□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 PKP4Q99569 1192 aa14.68□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 CALML5Q9NZT1 146 aa14.68□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa14.68□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 OR6C70A6NIJ9 312 aa14.68□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 TGFB1P01137 390 aa14.68□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 C8BP07358 591 aa14.68□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 GRK6P43250 576 aa14.68□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 GSK3BP49841 420 aa14.68□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 NDST2P52849 883 aa14.68□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 CDKL1Q00532 357 aa14.68□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 CREMQ03060 361 aa14.68□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 SOWAHAQ2M3V2 549 aa14.68□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa14.68□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 C6orf183Q5T699 404 aa14.68□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 PTF1AQ7RTS3 328 aa14.68□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 COX18Q8N8Q8 333 aa14.68□□□□□ -0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 GPR151Q8TDV0 419 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms