RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rnf8Q8VC56 488 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 B3galt6Q91Z92 325 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Akirin1Q99LF1 191 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nudt17Q9CWD3 296 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hm13Q9D8V0 378 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpr63Q9EQQ3 425 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp2g1Q9WV19 494 aa15.76■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm19965J3QNY8 723 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pdha2P35487 391 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cpne7Q0VE82 557 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SctrQ5FWI2 447 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RhocQ62159 193 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zbtb24Q80X44 710 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ago1Q8CJG1 857 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Chchd6Q91VN4 273 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q9CPZ3 230 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Upk3bl1Q9D701 249 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Erap1Q9EQH2 930 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 5830411N06RikB3F5L4 1112 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Apol11bE9PUZ0 337 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam181aJ3QNB7 292 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ncam1P13595 1115 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NfycP70353 335 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 IdsQ08890 552 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GstcdQ5RL51 634 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Foxj1Q61660 421 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dnajc15Q78YY6 149 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rbm11Q80YT9 238 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Map4k5Q8BPM2 847 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SynpoQ8CC35 929 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ptgr2Q8VDQ1 351 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1311Q8VET0 312 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mat2bQ99LB6 334 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rpl34Q9D1R9 117 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adad2Q9D5P4 478 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GatmQ9D964 423 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 P33monoxQ9DBN4 303 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm7682A0A0J9YUM1 481 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Xpnpep3B7ZMP1 506 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hmga1P17095 107 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vps26aP40336 327 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Emx1Q04742 257 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fpr-rs6Q3SXG2 339 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gdpgp1Q3TLS3 386 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Phlda1Q62392 405 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Thnsl2Q80W22 483 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Krr1Q8BGA5 380 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rab39aQ8BHD0 217 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MylipQ8BM54 445 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Snx16Q8C080 344 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam126bQ8C729 530 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ScaiQ8C8N2 606 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ftsj1Q8CBC7 324 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 EtfaQ99LC5 333 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cntd1Q9D995 334 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sae1Q9R1T2 350 aa15.75■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Igkv10-96A0A140T8M1 115 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 A0A286YDU1 74 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ankrd16A2AS55 361 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Aldoart2A6ZI47 364 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr237-ps1K9J725 310 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Asna1O54984 348 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Akap3O88987 864 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 H2-AaP01910 256 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Itgb1P09055 798 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pabpc1P29341 636 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Wnt8aQ64527 354 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nlgn2Q69ZK9 836 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zmpste24Q80W54 475 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zmym6Q8BS54 1249 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rbm4Q8C7Q4 361 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rbm4bQ8VE92 357 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DgkgQ91WG7 788 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ptgr1Q91YR9 329 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc44a3Q921V7 656 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ints11Q9CWS4 600 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Plpp6Q9D4F2 292 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DguokQ9QX60 277 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hsd17b10O08756 261 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nfkb1P25799 971 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hpcal1P62748 193 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Smim24Q0VG18 120 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MocosQ14CH1 862 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 FaddQ61160 205 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam126aQ6P9N1 521 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q810N5 247 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccdc17Q8CE13 565 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Eif3lQ8QZY1 564 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sf3b4Q8QZY9 424 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp4f3Q99N16 524 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PtprfA2A8L5 1898 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sec14l5B2RXM5 696 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 FiglaO55208 194 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vti1bO88384 232 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MaptP10637 733 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Copz1P61924 177 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Scn1bP97952 218 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdk15Q3V3A1 433 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Egfl8Q6GUQ1 293 aa15.74■□□□□ 0.11
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DgkbQ6NS52 802 aa15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 47.3 ms