RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	IFNA2	P01563	188 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	AHSG	P02765	367 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	OR52Z1	P0C646	297 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	THRA	P10827	490 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	CTSE	P14091	401 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	DRD4	P21917	467 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	CDC25A	P30304	524 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	SPAM1	P38567	509 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	PNPLA4	P41247	253 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	ACOT2	P49753	483 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	DEFA6	Q01524	100 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	TRIM29	Q14134	588 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	ELOC	Q15369	112 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	MPPE1	Q53F39	396 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	HPS6	Q86YV9	775 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	DAW1	Q8N136	415 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	CPXM2	Q8N436	756 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	ACBD4	Q8NC06	268 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	CT55	Q8WUE5	264 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	FAR1	Q8WVX9	515 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	THAP4	Q8WY91	577 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	DERA	Q9Y315	318 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	CEP83	Q9Y592	693 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	LRP4	O75096	1905 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	ANKRD62	A6NC57	917 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768		H3BML4	177 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768		M0QYG6	137 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768		M0QYT0	321 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	FPGT	O14772	594 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	ALPI	P09923	528 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	NR2F6	P10588	404 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	PF4V1	P10720	104 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	CD1C	P29017	333 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	MAN1A1	P33908	653 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	LIG4	P49917	911 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	SLC12A3	P55017	1021 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	WNT3	P56703	355 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	PPARD	Q03181	441 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	MYBPH	Q13203	477 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	PKP1	Q13835	747 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	IQCB1	Q15051	598 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	TBCC	Q15814	346 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	ACOT1	Q86TX2	421 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	GKN2	Q86XP6	184 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	CD302	Q8IX05	232 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	DPF1	Q92782	380 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	SPAG5	Q96R06	1193 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	MED10	Q9BTT4	135 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	PDE7B	Q9NP56	450 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	LRFN1	Q9P244	771 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	MTMR6	Q9Y217	621 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MLH1-223	ENST00000616768	C2CD2	Q9Y426	696 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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