RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616449.1

ACSS3-208, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, human

Gene ACSS3, Length 3,833 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSS3-208	ENST00000616449	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	ILVBL	A1L0T0	632 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC28A1	O00337	649 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	GPC1	P35052	558 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	ATP6V1E1	P36543	226 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	WAS	P42768	502 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	ACADVL	P49748	655 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	ARSF	P54793	590 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	CES5A	Q6NT32	575 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	KDELR3	O43731	214 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	OAZ2	O95190	189 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	RAP2A	P10114	183 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	MTHFD2	P13995	350 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	ALOX12	P18054	663 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	HNF1B	P35680	557 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	SERPINB10	P48595	397 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	HKDC1	Q2TB90	917 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	TPK1	Q9H3S4	243 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	SGK2	Q9HBY8	427 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	SPG21	Q9NZD8	308 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449		A0A1W2PQY0	241 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	PER2	O15055	1255 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	RFC2	P35250	354 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	INHBE	P58166	350 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	FOXJ1	Q92949	421 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM247	A6NEH6	219 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	TARM1	B6A8C7	271 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	TPST2	O60704	377 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	GSTM1	P09488	218 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM163B	P0C2L3	166 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	ATF6	P18850	670 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	TNFRSF1B	P20333	461 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	AGXT	P21549	392 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449		Q6ZVL8	140 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC39A13	Q96H72	371 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	NODAL	Q96S42	347 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	MAPK1	P28482	360 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	IHH	Q14623	411 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	KANK2	Q63ZY3	851 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	CCDC103	Q8IW40	242 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	TMCO1	Q9UM00	188 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449		Q9Y3F1	56 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	INPPL1	O15357	1258 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	MAP2K4	P45985	399 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	ZBED5	Q49AG3	693 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	ITIH5	Q86UX2	942 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	SGCD	Q92629	289 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	ISL2	Q96A47	359 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	INPP5K	Q9BT40	448 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449		H0Y858	1186 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	S100A5	P33763	92 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	OR1E2	P47887	323 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
ACSS3-208	ENST00000616449	HTRA3	P83110	453 aa		12.47	□□□□□ -0.41

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