RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611151.4

RAB18-208, Transcript of RAB18, member RAS oncogene family, human

TSL 5 BASIC

Gene RAB18, Length 4,931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB18-208	ENST00000611151	HLA-E	P13747	358 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	IL7R	P16871	459 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	PGD	P52209	483 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	RAPSN	Q13702	412 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	OAF	Q86UD1	273 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	PMEPA1	Q969W9	287 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	TMEM209	Q96SK2	561 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	GALNT8	Q9NY28	637 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	IRGM	A1A4Y4	181 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	CAPN8	A6NHC0	703 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	GIMD1	P0DJR0	217 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	HMGCS1	Q01581	520 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	SAMD11	Q96NU1	681 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	OXSM	Q9NWU1	459 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	OR5F1	O95221	314 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	TGFB1	P01137	390 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	PQLC3	Q8N755	202 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	LRRC15	Q8TF66	581 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	CDK15	Q96Q40	435 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151		A0A1W2PRB8	838 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	PITPNM1	O00562	1244 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	TSC22D2	O75157	780 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	TNF	P01375	233 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	EPO	P01588	193 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	RING1	Q06587	406 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	ANO7	Q6IWH7	933 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	FAM149A	A5PLN7	773 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151		A8MT66	165 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	HCN1	O60741	890 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	GJB5	O95377	273 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	PRPS1L1	P21108	318 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	MPI	P34949	423 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	OLR1	P78380	273 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	PCDH1	Q08174	1060 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	C14orf80	Q86SX3	495 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	GPR151	Q8TDV0	419 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	KAT2A	Q92830	837 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	PEBP4	Q96S96	227 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	GALP	Q9UBC7	116 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	KCTD3	Q9Y597	815 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151		H0YC42	278 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	IL12B	P29460	328 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	FRG2	Q64ET8	278 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	C17orf99	Q6UX52	265 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	AVL9	Q8NBF6	648 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	C1orf74	Q96LT6	269 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	FRG2B	Q96QU4	278 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	CDH7	Q9ULB5	785 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151		A0A0D9SEW6	157 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	TULP3	O75386	442 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	KCT2	Q8NC54	265 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	LMO3	Q8TAP4	145 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	ABI3	Q9P2A4	366 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151		A0A0J9YVX5	310 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	FAM234B	A2RU67	622 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	CAPG	P40121	348 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	PTPN5	P54829	565 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	CDH12	P55289	794 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151	GPR107	Q5VW38	600 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB18-208	ENST00000611151		Q6ZVL8	140 aa		13.51	□□□□□ -0.25

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