RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605833.1

VIM-AS1-202, VIM antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene VIM-AS1, Length 918 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIM-AS1-202ENST00000605833 KATNAL2Q8IYT4 538 aa20.17■□□□□ 0.82
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VIM-AS1-202ENST00000605833 LRRC57Q8N9N7 239 aa20.17■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 ALS2CR12Q96Q35 445 aa20.17■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 AMFRQ9UKV5 643 aa20.17■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 ICKQ9UPZ9 632 aa20.17■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa20.17■□□□□ 0.82
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VIM-AS1-202ENST00000605833 PCM1Q15154 2024 aa20.17■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 CFAP99D6REC4 459 aa20.16■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 CBX6O95503 412 aa20.16■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZIC1Q15915 447 aa20.16■□□□□ 0.82
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VIM-AS1-202ENST00000605833 SPESP1Q6UW49 350 aa20.16■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 PEX26Q7Z412 305 aa20.16■□□□□ 0.82
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VIM-AS1-202ENST00000605833 GPR135Q8IZ08 494 aa20.16■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 KRT35Q92764 455 aa20.16■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
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VIM-AS1-202ENST00000605833 RANBP9Q96S59 729 aa20.16■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 DHRS4Q9BTZ2 278 aa20.16■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 C5AR2Q9P296 337 aa20.16■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 CDYLQ9Y232 598 aa20.16■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 WIPF3A6NGB9 483 aa20.15■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 OR2B3O76000 313 aa20.15■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 CRTAMO95727 393 aa20.15■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 HBQ1P09105 142 aa20.15■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 MC4RP32245 332 aa20.15■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 FOLR3P41439 243 aa20.15■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 SPARCL1Q14515 664 aa20.15■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 DCAF10Q5QP82 559 aa20.15■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 BBS12Q6ZW61 710 aa20.15■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 GALNT16Q8N428 558 aa20.15■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 CLEC1AQ8NC01 280 aa20.15■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 FAM118BQ9BPY3 351 aa20.15■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 MVB12BQ9H7P6 319 aa20.15■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
VIM-AS1-202ENST00000605833 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
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VIM-AS1-202ENST00000605833 CROCCQ5TZA2 2017 aa20.14■□□□□ 0.81
VIM-AS1-202ENST00000605833 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa20.14■□□□□ 0.81
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VIM-AS1-202ENST00000605833 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa20.14■□□□□ 0.81
VIM-AS1-202ENST00000605833 APOC2P02655 101 aa20.14■□□□□ 0.81
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VIM-AS1-202ENST00000605833 CCDC181Q5TID7 509 aa20.14■□□□□ 0.81
VIM-AS1-202ENST00000605833 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa20.14■□□□□ 0.81
VIM-AS1-202ENST00000605833 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa20.14■□□□□ 0.81
VIM-AS1-202ENST00000605833 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa20.14■□□□□ 0.81
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VIM-AS1-202ENST00000605833 SERPINA9Q86WD7 417 aa20.14■□□□□ 0.81
VIM-AS1-202ENST00000605833 RCOR2Q8IZ40 523 aa20.14■□□□□ 0.81
VIM-AS1-202ENST00000605833 CLDN19Q8N6F1 224 aa20.14■□□□□ 0.81
VIM-AS1-202ENST00000605833 TRIM58Q8NG06 486 aa20.14■□□□□ 0.81
VIM-AS1-202ENST00000605833 OR5AR1Q8NGP9 310 aa20.14■□□□□ 0.81
VIM-AS1-202ENST00000605833 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
VIM-AS1-202ENST00000605833 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa20.14■□□□□ 0.81
VIM-AS1-202ENST00000605833 C5orf34Q96MH7 638 aa20.14■□□□□ 0.81
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VIM-AS1-202ENST00000605833 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
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VIM-AS1-202ENST00000605833 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa20.14■□□□□ 0.81
VIM-AS1-202ENST00000605833 SLC5A6Q9Y289 635 aa20.14■□□□□ 0.81
VIM-AS1-202ENST00000605833 NTNG1Q9Y2I2 539 aa20.14■□□□□ 0.81
VIM-AS1-202ENST00000605833 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa20.13■□□□□ 0.81
VIM-AS1-202ENST00000605833 PEX12O00623 359 aa20.13■□□□□ 0.81
VIM-AS1-202ENST00000605833 ALPPP05187 535 aa20.13■□□□□ 0.81
VIM-AS1-202ENST00000605833 ACRV1P26436 265 aa20.13■□□□□ 0.81
VIM-AS1-202ENST00000605833 HADHAP40939 763 aa20.13■□□□□ 0.81
VIM-AS1-202ENST00000605833 GABRA4P48169 554 aa20.13■□□□□ 0.81
VIM-AS1-202ENST00000605833 CD151P48509 253 aa20.13■□□□□ 0.81
VIM-AS1-202ENST00000605833 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
VIM-AS1-202ENST00000605833 SSPNQ14714 243 aa20.13■□□□□ 0.81
VIM-AS1-202ENST00000605833 DENND5AQ6IQ26 1287 aa20.13■□□□□ 0.81
VIM-AS1-202ENST00000605833 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa20.13■□□□□ 0.81
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
VIM-AS1-202ENST00000605833 CCDC110Q8TBZ0 833 aa20.13■□□□□ 0.81
VIM-AS1-202ENST00000605833 ACTL9Q8TC94 416 aa20.13■□□□□ 0.81
VIM-AS1-202ENST00000605833 TBL1YQ9BQ87 522 aa20.13■□□□□ 0.81
VIM-AS1-202ENST00000605833 VPS37BQ9H9H4 285 aa20.13■□□□□ 0.81
VIM-AS1-202ENST00000605833 SPHK1Q9NYA1 384 aa20.13■□□□□ 0.81
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